AMS(Amsterdam Modeling Suite)发布了2023正式版,在ReaxFF分子动力学、材料力学性质模拟、化学反应分析与探索,以及DFT高精度计算尤其是GW方法、RPA近似方面有所改进。更详细的新功能介绍与教程,我们将会在AMS知识库中逐渐新增。
计算引擎
- 机器学习力场 M3GNet-UP-2022 几乎适用于所有材料
- 升级的ASE 接口用于AMS、PLAMS
- Quantum ESPRESSO 7.1 (适用于 Linux/Mac)
- TASKCC 泛函:提供更好的原子化能量
- 分子体系DFT计算:
- r2SCAN-3c(STO)
- RPA 近似:sigma-functional
- 限制性开壳层分子计算(要求整数占据,自旋极化>0),及其TDDFT计算
- 溶剂化方法 3D-RISM 计算焓、溶剂化自由能
- TD-DFT+TB 激发态结构优化
- 分析: 新的 NOCV 选项, 基于 SFO 的准粒子轨道, 新的PolTDDFT 分析选项,开壳层 IQA(Interacting Quantum Atoms)
- 光谱:
- GW-BSE: Bethe Salpeter equation:G0W0-BSE, evGW-BSE, qsGW-BSE,含自旋轨道耦合
- ECD谱(含自旋轨道耦合)
- 开壳层杂化泛函计算激发能的HDA近似,能够节省大体系计算量
- 磷光发射等Franck-Condon谱计算:自动考虑振动激发量子数
- 周期性体系DFT计算:
- 自洽迭代收敛性改进
- 增加了 GTO 基组选项
- MP2、RPA 近似、GW 方法计算分子
有机电子学
- qsGW+BSE 精确计算激发能(可考虑自旋轨道耦合)
- OLED workflows 更多新工具(包括更精确的电子态、激发态性质,以及GPU加速的LAMMPS分子动力学)
- 振动极化率
化学反应
- ACE-Reaction: 反应网络的快速预测
- 分子动力学纳米反应器:通过球形约束反应器的周期性的膨胀收缩,加速气相、液相、超临界相化学反应事件发生。
- 势能面探索与表征工具:局部最小值、一阶鞍点、高阶鞍点
- 创建动力学数据作为 CatalyticFOAM 输入,用于反应器尺度的模拟
- 改进 ChemTraYzer2:布居统计
- 统计指定化学键、分子数量变化曲线
- PyZacros:集成到 AMS 中,用于模拟催化表面分子现象的动力学Monte Carlo软件
分子动力学
流体与药物设计
- 新的构象搜索/结构筛选/热力学玻尔兹曼平均光谱的计算
- COSMO-UNIFAC 方法发布:UNIFAC 参数中可选
- QSPR预测液体粘度、蒸汽压,以及三相点温度、合成难易程度、溶度参数、等张比容、介电常数等
AMS最新应用案例
- ADF 应用案例:分子与团簇 DFT 计算
- 【国内课题组】镧系元素中 Am(VI) 多酸盐的超滤分离, Nature, 2023, 616, 482–487
- 【国家纳米科学中心高兴发课题组】远取代基对 MOF 催化活性的影响:比Hammett更普适的模型, npj Computational Materials 2023, 9:59
- 手性结合艺术美,Nature, 2023, volume 615, pages 418–424 (2023)
- 【国内课题组】柔性准固态水性锌离子电池:设计原理、功能化策略和应用, Advanced Energy Materials 2023, DOI: 10.1002/aenm.202300250
- 通过调节金属硫族化合物簇中的量子态将 CO2 转化为甲酸, Communications Chemistry, volume 6, Article number: 53 (2023)
- 【国内课题组】Buckybowl及其具有八元环和螺旋烯单元的手性杂化物, Chem. Sci., 2023, DOI: 10.1039/D3SC00658A
- 【国内课题组】高效、低剂量、超快咔唑X射线闪烁器(Advanced Optical Materials 2023)
- 【国内课题组】Stable Ketenyl Anions via Ligand Exchange at an Anionic Carbon as Powerful Synthons((Angew. Chem. Int. Ed. 20223)
- 【国内课题组】在富勒烯笼内稳定的具有U–C三键特性的USc2C2和USc2NC簇(JACS 2023))
- 六芳基衍生物结构和分子轨道的模块化合成和调节(JACS 2023)
- 高燃耗锆合金-2包层腐蚀层中镍的界面形态分析:XRD、XAS和LFDFT联合研究(Corrosion Sciencen 2023)
- 【国内课题组】铜碳炔阴离子配合物的合成及活性(Nat. Synth. 2023)
- 【国内课题组】“Z”-Type Tilted Quasi-One-Dimensional Assembly of Actinide-Embedded Coinage Metal Near-Plane Superatoms and Their Optical Properties(Adv. Sci. 2023)
- Cu(I)对NO的还原偶联(JACS 2023)
- BAND 应用案例:固体与表面 DFT 计算
- 【国内课题组】近红外特征是通过表面等离子体利用水将宽带 CO2 还原为碳氢化合物(Nat. Comm. 2023)
- 在环境条件下准 2D 钙钛矿薄膜中的光增亮实现高性能发光二极管(Adv. Funct. Mater. 2022)
- 周期性相对论 DFT 计算中 13 族元素 Tl 和 113 号元素Nh及其氢氧化物对不同石英表面的反应性(Inorg. Chem. 2022)
- Stone-Wales拓扑缺陷增强石墨烯/金属界面的键合与电子耦合(ACS Nano 2022)
- 【国内课题组】煤气化过程中 CuFe2O4 改性膨润土对元素Hg的吸附-氧化作用研究(Fuel 2022)
- 【国内课题组】Fe/Co 掺杂镍基载氧体的化学链燃烧反应机理和性能(Fuel ProcessingTechnology 2022)
- 甲烷在 MoO3(010) 表面催化脱氢的密度泛函理论研究(Comput. Theor. Chem. 2022)
- 【国内课题组】铌、铝共掺杂的 EuTiO3 合金中增强的低场磁热效应(J. Mater. Sci. Technol. 2022)
- Conformational Gap Control in CsTaS3(J. Am. Chem. Soc. 2022)
- ReaxFF 应用案例:反应分子动力学
- 【宁夏大学白红存教授课题组】基于 ReaxFF MD 模拟探索化学链燃烧中芳香族片段解聚的反应机制及复杂反应网络
- 【国内课题组】ReaxFF 模拟和实验验证甲醇和乙醇对正癸烷热解过程的影响, Journal of Molecular Liquids, 2023, DOI:10.1016/j.molliq.2023.121627
- 【宁夏大学白红存教授课题组】在分子和颗粒尺度上揭示 HSW 煤燃烧的反应机理和氮转化(Powder Technology 2023)
- Aldonic酸在金电极上电催化还原为Aldose(ACS Sustainable Chemistry & Engineering 2022)
- 【安徽工业大学顾铭言教授课题组】添加 H2 的 C2H2 燃烧中碳烟生长机理:反应分子动力学研究(International Journal of Hydrogen Energy 2022)
- 基于 ReaxFF 的偶氮苯衍生物非绝热动力学方法与力场训练(J. Chem. Phys.2022)
- 锂离子电池石墨负极 eReaxFF 力场的开发与应用(Journal of The Electrochemical Society 2022)
- 蛋白质聚集体热解产生的超轻气凝胶——实验与 ReaxFF 模拟(Materials Today 2022)
- 【天津大学刘国柱教授课题】超临界流体的不均性分布及其对反应行为的影响(JACS Au 2022)
- 【中南大学仲奇凡教授课题组】基于 HRTEM 探究多温度段煅后石油焦的微观结构特征演变及多尺度建模(Fuel 2022)
- 【国内课题组】伊利石层间阳离子与二氧化碳矿化机理的分子动力学模拟与实验研究(Journal of CO2 Utilization 2022)
- 【山东大学赵彤教授课题组】基于 ReaxFF 的分子动力学模拟血浆中OH自由基与癌细胞线粒体中琥珀酸脱氢酶之间的相互作用(Plasma Processes and Polymers 2022)
- 使用 ReaxFF 研究交联环氧聚合物的湿热降解(ACS Appl. Polym. Mater. 2022)
- 使用 ReaxFF 对新型石墨烯-玻璃碳混合材料的研究(Carbon 2022)
- 【宁夏大学白红存教授课题组】Fe/Co 掺杂镍基载氧体的化学链燃烧反应机理和性能(Fuel ProcessingTechnology 2022)
- 利用 ReaxFF 模拟理解生物基复合材料(PNAS 2022)
- 聚四氟乙烯如何润滑铁:反应分子动力学的原子论观点(ACS Appl. Mater. Interfaces 2022)
- COSMO-RS 应用案例
- 通过计算溶剂筛选和实验从食物垃圾中提取有价值的化学物质, Separation and Purification Technology, 2023, DOI: 10.1016/j.seppur.2023.123719
- 一种用于大麻素模拟回收的高效液-液溶剂萃取新工艺(Separation and Purification Technology 2022)
- 天然疏水深共晶溶剂捕集预燃烧 CO2 研究(ACS Sustainable Chem. Eng 2022)
- 阿斯利康:药物工艺开发中溶解度预测模型的评估(Cryst. Growth Des. 2022)
- 使用共晶溶剂从黄褐藻中提取岩藻黄质— COSMO-RS 筛选与实验验证(Journal of Environmental Chemical Engineering 2022)
- 使用由 ZnCl2 处理过的废棉纤维制备的活性炭吸附CI-Reactive Red 141染料的新见解:统计物理、DFT、COSMO-RS 和 AIM 研究(Journal of Molecular Liquids 2022)
- 苯酚和天然生物碱绿色溶剂的研究:溶剂和萃取剂的选择(CHEM ENG J 2022)
- 光化学电池染料氧化还原电位的自动评估(Phys. Chem. Chem. Phys. 2022)
- Advance WF 应用案例