ReaxFF相关的新功能 – ChemTraYzer 2

ReaxFF是一种基于力场，通过分子动力学、蒙特卡洛，模拟一定条件下的化学反应，得到产物分布、基元反应、反应速率等重要信息，探索未知反应的有力研究工具。最近几年，AMS中的ReaxFF功能迅速进入国内各大高校、研究院所，在燃烧、裂解、催化、超临界、电池、电气工程、建材、摩擦、生物药物、钙钛矿、半导体、含能材料、化学气相沉积等诸多领域有了非常广泛而成功的应用。

基于AMS中高效率并行化计算，以及丰富的模拟模型、分析工具，AMS2022增加了AdvancedWorkFlow（AdvancedWF）模块，该模块包含最新的化学反应分析算法ChemTraYzer 2支持ReaxFF的化学反应分析。相对于ChemTraYzer，性能与功能上具有大幅度改进。

性能

• ChemTraYzer仅能用于小分子体系的反应，ChemTraYzer 2不仅适用于小分子体系，大分子乃至聚合物、固体表面等，均能正确分析，而且大分子内部断键、成键也能检测到
• 轨迹文件较大时，ChemTraYzer 2分析效率大大提高
• ChemTraYzer 2支持用户自由指定时间范围进行分析，超大轨迹文件的分析处理更加灵活
• ChemTraYzer有时候存在无法分析出结果的情况，ChemTraYzer 2不再出现
• ChemTraYzer 2分析控制参数更加灵活有效

功能

• 以SMILES格式列出反应方程式、反应的级数
• 反应速率常数（统计平均值，最大值，最小值），与旧版的速率常数不同，新版的速率常数单位为cm³/(mol∗s)、cm²/(mol²∗s)等，与实验单位一致，不再需要用户复杂换算
• 如上图所示，上方表格列出所有反应方程式，下方表格列出该方程式对应的每个反应事件，用户点击具体某个反应事件，Movie窗口将只呈现该反应事件中相关原子的动态过程，时间轴自动调整到合适位置，便于用户更清晰的观察、检验结果
• 支持用户导出反应方程式列表的*.csv表格文件

AdvancedWF模块是AMS2022新增模块，除了ChemTraYzer 2，还包含ParAMS（ReaxFF力场拟合、DFTB参数拟合）、微观动力学、OLED数据库与流程、ACE Reaction等功能。

ChemTraYzer 2的使用，参考英文教程：

https://www.scm.com/doc.2022/Tutorials/MolecularDynamicsAndMonteCarlo/ChemTrayzer2.html