ReaxFF是一种基于力场，通过分子动力学、蒙特卡洛，模拟一定条件下的化学反应，得到产物分布、基元反应、反应速率等重要信息，探索未知反应的有力研究工具。最近几年，AMS中的ReaxFF功能迅速进入国内各大高校、研究院所，在燃烧、裂解、催化、超临界、电池、电气工程、建材、摩擦、生物药物、钙钛矿、半导体、含能材料、化学气相沉积等诸多领域有了非常广泛而成功的应用。
基于AMS中高效率并行化计算，以及丰富的模拟模型、分析工具，AMS2022增加了AdvancedWorkFlow（Advanced WF）模块，该模块包含最新的化学反应分析算法ChemTraYzer 2支持ReaxFF的化学反应分析。
性能
- ChemTraYzer仅能用于小分子体系的反应，ChemTraYzer 2不仅适用于小分子体系，大分子乃至聚合物、固体表面等，均能正确分析，而且大分子内部断键、成键也能检测到
- 轨迹文件较大时，ChemTraYzer 2分析效率大大提高
- ChemTraYzer 2支持用户自由指定时间范围进行分析，超大轨迹文件的分析处理更加灵活
- ChemTraYzer有时候存在无法分析出结果的情况，ChemTraYzer 2不再出现
- ChemTraYzer 2分析控制参数更加灵活有效
使用
在ReaxFF模拟产生的Movie中，MD Properties → Reaction detection: ChemTrazYer2.0，弹出该参数窗口：
- T stable：滤除存在时间过短的中间体，即滤除一些由于体系密度过大，或热碰撞而产生的假产物中间体（实际碰到一起之后，可能立即就弹开了）的反应，用户可以逐渐增大到20fs、40fs，对比一下反应数量，从而了解假反应的存在情况
- 如果勾选Write mol population与Write events per time，则可以在生成的结果中包含产物的占比，及其Mann-Kendall值（描述一个物种表现得像反应物或产物的程度），以及总体反应次数、总体键变化次数柱状图（横坐标为时间）等
- First Frame与Final Frame：设置分析从哪一帧到哪一帧之间的反应
- 其他参数一般保存默认即可
功能
- 以SMILES格式列出反应方程式、反应的级数
- 反应速率常数（统计平均值，最大值，最小值），与旧版的速率常数不同，新版的速率常数单位为cm3/(mol∗s)、cm2/(mol2∗s)等，与实验单位一致，不再需要用户复杂换算
- 如上图所示，上方表格列出所有反应方程式，下方表格列出该方程式对应的每个反应事件，用户点击具体某个反应事件，Movie窗口将只呈现该反应事件中相关原子的动态过程，时间轴自动调整到合适位置，便于用户更清晰的观察、检验结果
- 支持用户导出反应方程式列表的*.csv表格文件
如果勾选了Write mol population与Write events per time，产生的结果类似如下：
点击第三部分列表中的一行，将弹窗左下角改为Bar，并设置合适的宽度，例如2000，将生成柱状图类似如下：
如果按住Ctrl键，选中第三个表格中的多行，将产生相关的几种分子的数量变化曲线：
Advanced WF其他功能
AdvancedWF模块是AMS2022新增模块，除了ChemTraYzer 2，还包含ParAMS（ReaxFF力场拟合、DFTB参数拟合）、微观动力学、OLED数据库与流程、ACE Reaction等功能。
ChemTraYzer 2的使用，参考英文教程：
https://www.scm.com/doc.2022/Tutorials/MolecularDynamicsAndMonteCarlo/ChemTrayzer2.html