检测水环境中Co2+的高灵敏度、高选择性氨基硫脲化学传感器(Scientific Reports 2021)

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使用有机化合物的化学传感器,可以作为识别水环境中金属离子的优秀可选方案。传感器的优化过程严重影响所设计传感器的性能,在本研究中,采用响应面法(RSM)成功开发了一种利用有机化合物(即氨基硫脲连接乙酰吡嗪,TLA)识别不同环境水样中Co2+离子的高灵敏度和选择性比色传感器系统。作者建立的模型得到了成功的优化,并且具有统计显著的独立的变量(p<0.05),在pH值为5.3、100:70µM TLA/Co2+浓度、二甲基亚砜/水反应体积比8:2、反应时间15 min,达到最佳识别。在最佳条件下,TLA传感器可识别浓度低至1.637µM的Co2+离子,这低于火焰原子吸收光谱法(FAAS)的检测限。理论方法支持实验数据,并对化学传感系统中TLA-Co2+的机械非共价相互作用进行了表征和预测。最后,本研究中产生的所有积极结果表明,TLA可作为识别水中Co2+污染的替代和可比探针,具有成本效益、可移动且易于处理、无需特殊培训且环保。 在理论方面,利用COSMO-RS方法对TLA在其介质中的分子极化或相互作用进行了理论研究;通过计算Fukui函数来确定何种原子更易位于亲核区和亲电区;采用TDDFT方法验证了所建议的配合物结构以及TLA与Co2+离子之间的相互作用;结合NCI-RDG方法,TD-DFT方法提出的模型进一步用于描述该化学传感系统中TLA和Co2+离子之间发生的相互作用类型。 参考文献: Hakimah Ismail, Mohammad Norazmi Ahmad & Erna Normaya, A highly sensitive and selective thiosemicarbazone chemosensor for detection of Co2+ in aqueous environments using RSM and TD/DFT approaches, Scientific Reports volume 11, Article number: 20963 (2021)

MBe2 (M=Zr, Hf)中的π-π键与超导性(Angew. Chem. Int. Ed. 2021)

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丹麦奥胡斯大学Maarten G. Goesten教授,近期发表了关于MBe2 (M=Zr, Hf)层状结构能带与层间相互作用能,及其超导性的研究结果。铍是一种s区元素,在ZrBe2和HfBe2合金中形成离域Be-Be π键的芳香族网络,从而构造出[Be2]4-层状堆叠,中间为+4价阳离子(如下图所示)。[Be2]4-亚晶格与石墨等电子、同构,MgB2中的[B]-2亚晶格也是如此,并且在其电子能带结构中与π键具有相同的表现。 它们在布里渊区的K和H处,出现能级的(近)简并,但由于层间轨道相互作用,而导致能量上的分离。Zr和Hf利用它们的价态d轨道,在层与层间形成键,导致几乎相同的能带结构。像MgB2一样,ZrBe2和HfBe2在环境压力下,经计算为声子介导的超导体,临界温度分别为11.4 K和8.8 K。声子和自由电子之间的耦合强度非常相似,因此临界温度的差异,由层间阳离子的质量(Mass)控制。 本文的DFT计算采用AMS软件BAND模块完成。 参考文献: Maarten Goesten, Be-Be π bonding and predicted superconductivity in MBe2 (M=Zr, Hf), Angew. Chem. Int. Ed., 2021, DOI:10.1002/anie.202114303

卤化物钙钛矿:高效准确的DFTB模拟( J. Chem. Inf. Model 2021)

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对金属卤化物钙钛矿材料性质的全面理解,对于提高未来太阳能电池的稳定性和效率至关重要。毫无疑问,计算模拟是在原子水平上描述金属卤化物钙钛矿的物理化学性质的一个非常有价值的工具。为了彻底了解这些复杂系统,需要对相对较大体系中的电子和离子进行同时建模,这对DFT计算来说代价很大。埃因霍温技术大学的研究人员,近期验证了最近的GFN1-XTB DFTB方法用于模拟卤化物钙钛矿性质的适用性。 他们评估了GFN1-xTB的性能,并计算了几种金属卤化物钙钛矿的结构、能量、振动和光电特性。对一系列具有不同化学成分(阳离子、金属、阴离子)以及结构相(立方、四方、正交)的卤化物钙钛矿进行了与实验、DFT计算的综合比较。 结果表明,GFN1-xTB方法可以处理比标准DFT计算更大的体系和更长的时间尺度,而计算成本很低,同时在计算各种结构和电子性质时保持较高的精度。虽然DFTB在模拟钙钛矿方面显示出很高的通用性,但仍有改进的余地,最显著的是某些结构相,经过几何弛豫后发生的结构畸变,以及含有复杂动态键的离子的错误电子描述。由于xTB哈密顿量的可调性质,作者设想通过重新参数化来改善DFTB的性能。基于AMS的ParAMS,能够训练ReaxFF、DFTB参数。 参考文献: J. M. Vicent-Luna, S. Apergi, S. Tao, Efficient Computation of Structural and Electronic Properties of Halide Perovskites Using Density Functional Tight Binding: GFN1-xTB Method, J. Chem. Inf. Model. 61, 4415 (2021)

NMR的剧烈增强方法:PHIP-X(JACS 2021)

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对于许多化学和生物医学应用,如反应监测或体内代谢的实时观测,核磁共振信号通常太弱。德国、俄罗斯多所大学联合研究,发展了一种增强核磁共振信号的新方法:通过质子交换中继的仲氢极化(PHIP-X),这种新方法实现了超50000倍的信号增强。 PHIP获得的极化非常强,通过质子交换实现的极化转移,具有广泛的适用性,PHIP-X将两者优势结合,能够增强1H和13C信号。在技术,已经验证能强烈增强不同醇、水、乳酸、丙酮酸和葡萄糖的核磁共振信号。PHP-X具有如此强和多用途的NMR增强,为核磁共振在化学和生物医学领域的许多潜在应用提供了新的基础。 本文使用AMS中ADF、BAND计算H-H J-coupling等。 参考文献: K. Them et al., Parahydrogen-Induced Polarization Relayed via Proton Exchange, J. Am. Chem. Soc. 143, 13694 (2021)

使用ReaxFF研究卤化物钙钛矿的不稳定性(J. Phys. Chem. Lett. 2021)

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近年来,卤化物钙钛矿引起了人们极大的关注。高转换效率、低生产成本和易于制造,使其成为太阳能电池技术的理想候选。尽管有这些优点,钙钛矿型太阳能电池的商业化,仍受长期稳定性差这个问题所障碍。长期稳定性差是由各种尚未完全了解的材料固有过程造成的。埃因霍温理工大学(TU/E)和宾夕法尼亚州立大学(PSU)的研究人员,在最近的一篇论文中,使用ReaxFF进行反应分子动力学模拟,揭示了卤化物钙钛矿中降解过程的原子细节。 这是首次使用ReaxFF研究卤化物钙钛矿(CsPbI3)的报道。I/Pb/Cs参数由精确的量子力学计算数据作为训练集,使用和蒙特卡罗方法优化获得。所得到的参数集用于研究无机卤化物钙钛矿中的一系列动力学和反应过程。 新的ReaxFF参数能够预测卤化物钙钛矿的适当相和动力学行为。反应分子动力学模拟揭示了钙钛矿晶格分解为PbI2的原子机制。   在碘空位(红点)存在的情况下,铅物种可以离开其在晶格中的位置,形成局部富Pb/I的区域,进一步演化形成Pb/I簇。 参考文献: M. Pols, J. M. Vicent-Luna, I. Filot, A. C. T. van Duin, and S. Tao, Atomistic Insights Into the Degradation of Inorganic Halide Perovskite CsPbI3: A Reactive Force Field Molecular Dynamics Study, J. Phys. Chem. Lett. 12, 5519–5525 (2021).

水钠锰矿电容机理的实验与模拟研究(Nat. Mater. 2021)

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从电解质中吸附和嵌入离子到电极材料的中间层是电化学储能的关键过程,一般有两种机制:1)吸附产生静电相互作用,导致非法拉第双电层(EDL);2)特定吸附生成化学键,导致法拉第赝电容。一般认为,这两种机制是相互排斥的。循环伏安法和恒电流循环实验表明水钠锰矿(一种水合层状锰氧化物 δ-MnO2; AxMnO2·yH2O,其中A为碱离子,~0.1<x<0.7和0.3<y<2)中形成EDL,而结构、键合和锰氧化状态变化的测量表明存在伪电容行为。 为了解决水钠锰矿中EDL和赝电容之间的区别,北卡罗来纳州立大学、宾夕法尼亚州立大学、橡树岭国家实验室和加州大学河滨分校的研究人员,最近在Nature Materials发表的论文中,使用多模式实验与计算模拟结合,研究了层间约束和水合作用的影响。 研究表明,水钠锰矿的电容行为起源于阳离子插入水合夹层。结合XRD、EQCM、AFM膨胀计,以及DFT和ReaxFF巨正则蒙特卡罗(GCMC)模拟研究表明,结构和质量的大部分变化归因于阳离子的插入/脱插。ReaxFF GCMC模拟表明,最可能的中间物是H2O和K+,而不是H3O+或SO42-,并且层间的局部不均匀性导致了水钠锰矿层的灵活性。不过,考虑到由于限制作用导致溶剂化壳层较小,层间K+和表面氧之间的距离仍然很大(~3Å)。因此,限制下的电容电荷存储不是纯EDL或伪电容,而是基于插层离子与主体材料之间的相互作用距离的连续介质。 本文中基于ReaxFF的GCMC模拟是在AMS2019.3中使用ReaxFF模块完成的。 参考文献: Boyd, S., Ganeshan, K., Tsai, WY. et al. Effects of interlayer confinement and hydration on capacitive charge storage in birnessite. Nat. Mater. (2021).

水相多酸的理论分析

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由于描述所有化学平衡的高度复杂性,多酸在水溶液中的自组装问题,仍然是一个需要研究的课题。实验技术在这一问题的研究上取得了巨大的成功,但还需要更多的努力来促进这些金属氧化物在材料科学中的应用(详见综述)。去年,ICIQ的研究人员开发了一种名为POMSimulator的模拟器,用于描述小钼团簇的水相形态。 为了充分再现钼和钨氧化物的水相形态,今年代码得到进一步扩展,对122种金属氧化物结构进行了优化,并用ADF计算了它们的解析频率。结果被传递给POMSimulator,该模拟器预测了所考虑的所有多金属氧酸盐的平衡常数。理论常数与实验常数呈线性关系,表明ADF的自由能可以直接重新标度。 参考文献: [1] Petrus, E.; Segado, M.; Bo, C. Nucleation Mechanisms and Speciation of Metal Oxide Clusters, Chemical Science 2020, 11, 8448 [2] Petrus, E.; Bo, C. Unlocking Phase Diagrams for Molybdenum and Tungsten Nanoclusters and Prediction of Their Formation Constants, J. Phys. Chem. A 2021, 125, 5212

金和银纳米团簇的光学和光致发光特性

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目前的研究已经证明,银和金纳米团簇具有高效、稳定的光学与发射特性,并可通过改变其的几何构型与电子结构进行有效调节。对尺寸、形状、表面配体、电荷状态等方面的依赖性,使得这些纳米团簇应用于从生物成像到催化等广泛领域。借助量子化学方法,诸如如DFT、TDDFT和TDDFT+TB,能够从理论层面阐明其特定性质的物理根源。 在最近的一篇论文中,作者使用ADF中的TDDFT方法研究了Au14Cd(S-Adm)12的激发态势能面,从几何结构与电子态角度,阐释了实验上观察到的双发射的机理。两个发射极小值都被确定到第一电子激发态,发射间隔为0.24 eV。 Ag29(BDT)12−x(DHLA)x NCs (x = 1−6, 12)是纳米团簇发光的另一个例子,其光学性质随着配体改变(BDT改为DHLA)而改变。作者通过DFT计算,除了预测了完全取代的Ag29(DHLA)12的几何结构,还发现虽然在BP86/DZ理论水平上的TDDFT计算与实验结果相比有所低估,但使用长程修正泛函计算表明,光致发光机制可能主要由金属-金属转变产生。 在这两项研究目中,TDDFT+TB为这些纳米团簇光学性质的计算发挥了强大作用,以非常低的计算成本复现了从TDDFT获得的光谱。总之,这两篇文章概述了一种理论方法,用于理解纳米团簇与光之间的辐射相互作用,导致的几何结构和电子差异。 参考文献: [1] S. Havenridge, C. M. Aikens, Deciphering the Dual Emission in the Photoluminescence of Au14Cd(SR)12: A Theoretical Study using TDDFT and TDDFT+TB J. Chem. Phys. 155, 074302 (2021) [2] Y. Zeng, S. Havenridge, M. Gharib, A. Baksi, K. L. D. M. Weerawardene, A. R. Ziefub, C. Strelow, C. Rehbock, […]

AMS在电池材料模拟与设计中的应用

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概述 理论计算模拟能够非常有效地辅助电池候选材料筛选、理解材料与性质之间的关系,对缩短研发时间、降低研发成本,发挥着越来越重要的作用。AMS 包含 DFT、DFTB、ForceField 等尺度级别的原子级材料模拟方法,宏观流体热力学性质预测,以及大量材料学模型构建和性质分析模块,特别适合分析如电池材料等复杂材料体系的性质。AMS 在研究电池材料方面有如下功能特点: 材料模型与数据库 晶体、缺陷、表面、界面等建模工具 内置数据库中导入结构模型,以及外部数据库数据读入 复杂材料模型 随机均相、非均相混合物 交联聚合物材料的聚合反应与交联率 聚合物力学性质分析 电池材料的电荷迁移、扩散、粘度预测:ReaxFF,Apple&P,DFTB 电解质的溶解度和电化学性质: 通过ADF、COSMO-RS精确计算氧化还原势、电离能 COSMO-RS预测溶解度 eReaxFF模拟电解质的降解 充放电过程模拟:基于ReaxFF或DFTB,进行巨正则系综蒙特卡洛模拟 阴极的膨胀 电压下降-Li浓度关系 扩散诱导应力 计算分子材料的核磁共振谱与NEXAFS性质 一维聚合物材料带隙筛选 模拟工具介绍 ReaxFF反应分子动力学,包含电池相关的多种力场 ChemtraYzer:自动生成化学反应路径、分析表面化学反应、统计产物数量变化、反应速率 TNEMD:热传导模拟 Molecule Gun:表面分子沉积模拟 Bond Boost:生成聚合物 支持用户使用MCFF、CMA-ES、ParAMS等方法自建、优化力场 eReaxFF:电子作为基本粒子参与化学反应的分子动力学模拟 GCMC:巨正则系综蒙特卡洛模拟,加速化学反应过程 Apple&P极化力场,模拟带电体系,如电解质(例如电池中的电荷迁移率)、离子液体、燃料电池膜等 方便地通过GUI模拟离子扩散、放电过程电压特性、材料分解、固态电解质界面形成、溶剂化与反应 密度泛函理论(DFT) 使用杂化泛函( HSE06、HSE03),更精确的计算电子结构,结合能和扩散势垒 对大体系计算,与平面波基组相比,使用 LCAO 基组可将速度大大提高倍,从而实现高效的大规模模拟 使用色散修正泛函,更精确的模拟结合能,找到吸附位点 基于DFT与COSMO-RS计算精确氧化还原电位 基于DFT的键能分解分析(EDA)深刻理解分子间的相互作用 比平面波方法高效的Slab模型 特别适合研究表面吸附,以及在电场情况下的表面物理化学性质 基于键能分解分析pEDA,分析表面成键 研究案例和发表文章 eReaxFF研究电子迁移和锂离子的还原(J. Electrochem. Soc. 169 ,110540, […]

配位不饱和Cu位点的精准合成及其在氯乙烯单体合成中的催化行为研究(ACS Catal. 2021)

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全球氯碱行业中,基于传统的电石法氯乙烯合成工艺开发一种高性能的、绿色的、可持续的非汞基非贵金属催化剂进程被严重掣肘。浙江工业大学李小年教授、赵佳副研究员团队基于非贵金属铜(Cu)基催化剂催化活性低、选择性差、寿命短等核心问题,通过一种简单的热活化工艺制备出一系列具有不同配位环境及空间限域特征的单原子Cu催化剂。通过基元反应路径的调控,借助动力学和理论模拟计算相结合的方式,对高催化性能触发背后的潜在机制进行揭示,并在此基础上探究了以Cu为代表的非贵金属催化剂在现有氯乙烯合成工艺中的适配机制。该研究对氯乙烯合成非贵金属催化剂的工业化应用具有显著的推进作用。 在本项工作理论模拟研究中,借助AMS软件BAND模块考察反应过程中反应物在单原子Cu位点上的吸附姿态和吸附结构并结合Hirshfeld电荷分析量化反应条件下Cu位点的电子态演变,从原子水平上揭示了乙炔的预先活化对高活性诱导的关键。进一步,在现有工业化工艺适配性研究中发现,具有较大的|Eads (C2H2)-Eads(VCM)|差分吸附能往往会使Cu催化剂表现出更强的乙炔活化能力,尤其是在氯乙烯富集、含硫气体杂质的影响下。除了乙炔氢氯化反应以外,本文的Cu原子反应性研究方法在其它卤化反应中可能具有潜在的应用,并为广泛催化应用中金属物种的可控调节提供了一种新的策略。 相关成果发表在:Wang B,; Jiang, Z.; Wang, T.; Tang, Q.; Yu, M.; Feng, T.; Tian, M.; Chang, R.; Yue, Y.; Pan, Z.; Zhao, J.;* Li, X.*. Controllable Synthesis of Vacancy-Defect Cu Site and Its Catalysis for the Manufacture of Vinyl Chloride Monomer. ACS Catal. 2021, 11, 11016-11028 原文见:https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acscatal.1c01921 相关研究可以参阅以下工作: [1] Zhao, J.; Wang, S.; Wang, B.; Yue, Y.; […]

 
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  • 基于缺陷工程与应变调控的金刚石理想中间带光电材料设计研究背景 随着全球能源需求的持续增长与环境问题的日益严峻,开发高效率光电转换材料成为新能源领域的重要研究方向。传统单结半导体光伏器件受 Shockley–Queisser 极限的限制,其光电转换效率难以进一步提升。为突破这一理论瓶颈,中间带(Intermediate-Band IB)光电材料被提出,通过在禁带中引入中间能级,使材料能够吸收低能光子,从而显著提高光谱利用率和器件效率。然而,实现理想中间带结构仍面临巨大挑战,尤其是在保证中间带与价带、导带有效分离及适当占据的条件下。 金刚石作为一种典型的宽禁带半导体,具有优异的热导率、化学稳定性和载流子迁移率,是构建高性能光电器件的潜在候选材料。然而,其超宽带隙限制了对可见光的吸收能力。近年来,缺陷工程被广泛用于在半导体中引入中间能级,但单一缺陷调控往往难以实现理想的中间带结构。同时,应变调控(应力工程)作为一种有效的能带调节手段,可进一步调控电子结构与能级分布。 因此,将缺陷工程与应变调控相结合,系统研究其对金刚石中间带形成及光电性能的影响,对于实现高效中间带光电材料具有重要意义,并为新型高效率光伏器件的设计提供理论依据。 研究内容 该研究围绕在金刚石中构建理想中间带光电材料这一目标,系统探讨了缺陷工程与应变调控协同作用对其电子结构的影响。首先,基于第一性原理计算,构建多种含缺陷的金刚石模型,分析其对能带结构和态密度的调控作用,重点考察缺陷在禁带中引入中间能级的能力及其位置分布。 图 1.(a)3 [...]
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