VNL作为LAMMPS的用户界面

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概述 LAMMPS 是一个应用广泛的经验力场分子动力学程序,使用VNL可以: 快速构建多种模型并导出LAMMPS的文件; 导入LAMMPS 分子动力学轨迹,并使用VNL中的分析功能进行分析。 现在申请【获取永久免费学术版的VNL图形界面】,即可获得这些功能! 使用VNL快速构建结构模型 导入数据库中的结构 导出LAMMPS的数据格式 构建块体、表面、界面结构 构建分子模型 构建随机合金、多晶体系 构建无定形体系 使用packmol将分子充填到晶胞 更多详细介绍,请参见:【VNL的建模功能】。 使用 VNL 分析 LAMMPS 的结果 VNL支持超大体系的显示和分析 原子数可达百万级 VNL可以直接由分子动力学轨迹得到体系的各种分布函数和性质: 径向分布函数 速度/动能分布 速度自相关函数 局域质量密度分布 局域应力分析 从MD轨迹计算声子DOS 配位数分析 角分布函数 均方位移 Evolution of average nearest neighbor number with tine 中子散射结构因子 弹性常数(应力-应变曲线) 多种函数重叠作图 支持柱状图、线状图 显示MD模拟过程的原子速度 显示MD动画并支持自定义显示、按帧导出结构 导出动画文件 相关实例教程 使用VNL产生无定形结构 英文教程:Generating Amorphous Structures VNL和LAMMPS一起使用进行分子动力学研究 教程:在VNL中导入LAMMPS轨迹文件。 […]

QuantumATK 的结果分析功能

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QuantumATK 的图形界面 NanoLab 提供丰富的数据处理与结果可视化工具。 更多功能介绍详见 QuantumATK功能列表。 能带分析工具 直接绘制能带图 自定义图元素属性(线性、线宽、文字、标尺) 添加文字说明、箭头等标记元素 导出png、eps、pdf等高精度图片格式文件 还可以导出数据用第三方软件作图 在图中交互式测量 直接给出带隙情况 有效质量分析工具 投影能带(FatBandStructure)分析工具 直接绘制投影能带图 支持多种作图方式 自定义图元素属性(线性、线宽、文字、标尺) 添加文字说明、箭头等标记元素 导出png、eps、pdf等高精度图片格式文件 投影态能带分析 投影到元素、原子(组)、壳层、轨道、自旋上的投影态密度 交互式选择分析 支持与能带、投影能带组合作图,同步分析 导出数据用第三方软件作图 态密度和投影态密度分析工具 直接绘制态密度图 支持多种作图方式 自定义图元素属性(线性、线宽、文字、标尺) 添加文字说明、箭头等标记元素 导出png、eps、pdf等高精度图片格式文件 投影态密度分析(ProjectedDOS) 投影到元素、原子(组)、壳层、轨道、自旋上的投影态密度 交互式选择分析 支持与能带、投影能带组合作图,同步分析 导出数据用第三方软件作图 演示视频:能带、态密度、投影能带与投影态密度的计算和作图 二维数据的比较作图 将两组二维数据进行比较作图 支持能带、态密度等 清晰反应不同结构、不同计算参数的效果差异 三维格点数据显示 支持绘制电子密度、电势、ELF等所有三维格点数据 绘图方式 等值面图 切面图 密度点图 自定义所有图形属性 背景、光照 晶格、原子 色调 等高线 二维数据面的立体化 可多个方向重复,更好反应周期性 导出高质量图像文件 […]