具有弹性的生物可降解聚合物在组织工程领域得到了广泛的关注，而聚酯是用于制造骨组织支架的常用生物材料。最近Adri van Duin等人利用加速反应分子动力学模拟，研究了柠檬酸盐聚合物的反应性。
由于酯和乙醚水解反应的活化能垒较高，反应所需时间相对于计算机模拟时间尺度（一般在ns级别的微观时间尺度）而言非常长，因此往往需要通过特殊的方法，加速分子动力学模拟中化学反应的发生。作者在ReaxFF框架内使用了bond boost加速反应方法（参阅教程），Bond boost参数的选择是通过人为调整得到。乙醚水解比酯水解能垒高，当bond boost参数降低时，乙醚水解几乎停止。另外对聚合物进行了机械拉伸模拟，以确定其拉伸模量，显示出应变相关的行为（另见应力应变教程），发现聚酯比聚醚具有更高的韧性。
参考文献：
Nabankur Dasgupta, Dundar E. Yilmaz, and Adri van Duin, Simulations of the Biodegradation of Citrate-Based Polymers for Artificial Scaffolds Using Accelerated Reactive Molecular Dynamics, J. Phys. Chem. B 124, 5311–5322 (2020)