AMS (Amsterdam Modeling Suite) 是一款适合计算化学初学者、实验工作者入手的专业的材料与化学模拟平台。包含完善、全面的计算模拟方法。原子水平的模拟方法,包括密度泛函、半经验量子化学、力场,以及多种方法结合的多尺度模拟分子动力学(以及基于分子动力学的FT-IR)、多种蒙特卡洛模拟,以及微观动力学模拟力场、DFTB参数支持自主扩展与优化。友好的图形界面,完成建模、计算、作业管理、结果分析、图谱展示。支持丰富的材料体系与性质分析工具,计算分子与团簇、聚合物、低维材料、框架结构材料、块体材料、宏观流体等多种材料模型,包括电子、结构、化学反应、化学键、谱学、能带、载流子迁移、力学、热力学,以及光的吸收、转换、发射与非线性光学等方面性质。
本培训课程领域涉及:分子与团簇等非周期性体系的DFT计算,周期性体系尤其是二维(例如表面)、一维体系(如聚合物)的DFT计算,通过基于力场的分子动力学、蒙特卡洛模拟化学反应,基于DFT、DFTB、MOPAC、ReaxFF的巨正则系综蒙特卡洛模拟,基于COSMO-RS模型的流体热力学模拟。
培训场次信息:
- 时间:2023年10月27日(周五)~29日(周日) 09:00 – 18:00
- 地点:四川大学望江校区
- 讲师:AMS中国技术支持 刘俊
- 费用:1200元/人 (不含交通食宿)
- 形式:上机为主,请学员自带笔记本电脑及插线板。提供AMS软件试用许可(现场发放)。
一、基于AMS软件的材料化学培训 内容提要:
- 建模:(2023年10月27日 周五)
- 小分子
- 自由基
- 固体
- 非均相建模:固-液、固-气、既有体系中添加新的气体或液体
- 聚合物建模
- 密度控制:压缩与拉伸
- ADF:分子与团簇的DFT计算 (2023年10月27日周五)
- 基态电子结构的理论概念与计算结果对照
- 作业管理与队列、在集群提交作业
- ADF的参数详细介绍
- 入门案例:水分子电子态计算
- 专题:
- 收敛问题的系统性解决
- 相对论与基组
- 结构优化、限制性结构优化、柔性势能面扫描
- 基态与激发态化学反应路径、自由能计算、频率计算
- 溶剂化
- 化学键分析:
- EDA-NOCV的理论理解
- 氢键
- 共价键:
- 点群、不可约表示、对称性
- EDA-NOCV的隐含规则
- 键级的计算
- QTAIM分析
- 谱学性质:
- 红外、振动圆二色谱VCD
- 拉曼光谱
- 激发态:
- 紫外可见吸收
- 磷光发射谱
- 系间窜越
- 非线性光学
- 转移积分与分子体系中的载流子迁移
- BAND:晶体、表面的DFT计算(2023年10月28日 周六)
- 参数介绍:周期性、相对论、k-空间、基组
- 结构优化
- 化学反应与过渡态计算
- 能带与态密度的计算:k点、能带路径
- COOP(比COHP方法更先进)方法分析能带与化学键的关系
- 外电场对能带的影响
- 化学键分析:表面吸附的EDA-NOCV分析
- 含O2的化学反应
- Quantum Espresso:晶体、表面的DFT计算(2023年10月28日 周六)
- 能带与态密度的计算
- 原子受力、压力张量
- Mopac/DFTB:半经验方法(2023年10月28日周六)
- 参数介绍
- 能带计算
- 基于DFTB的分子动力学
- COSMO-RS:流体热力学模拟与共晶筛选(2023年10月28日 周六)
- 分子三维结构筛选
- UNIFAC理论与使用
- COSMO-RS理论与使用
- COSMO-SAC理论与使用
- 应用:
- 固体溶质在液体中的溶解度与液体溶剂筛选
- 共晶的研究
- 气体在溶液中的溶解度、活度系数、亨利常数
- 分配系数
- 闪点
- 讨论与答疑(2023年10月28日 周六)
二、分子动力学培训内容提要:
- 分子动力学概念(2023年10月29日 周日)
- 方法原理
- 力场、步长、步数、保存轨迹频率、系综、
- 弛豫与结构优化
- 退火
- 键级
- 周期性边界条件
- 反应分子动力学ReaxFF
- 上机演示与练习(2023年10月29日 周日)
- 力场的选择
- 弛豫
- 退火
- 简单的反应分子动力学算例:燃烧与化学反应分析
- 作业提交与CPU负载管理
- 热导率的计算(两种模型)
- 力学性质:杨氏模量、屈服点、泊松比
- 力学性质:材料压力张量、在压力与压强下材料的应变
- 径向分布函数
- Li0.4S 中Li离子的扩散系数
- 机器学习势:M3GNet-UP-2022(2023年10月29日 周日)
- 反应分子动力学中的反应加速方法:(2023年10月29日 周日)
- fbMC
- (T)REMD
- CVHD
- Bond Boost
- 纳米反应器
- 补充:(2023年10月29日 周日)
- Python脚本的编辑
- 分子动力学的重启
- 分子动力学模拟化学反应过程中,统计化学键数量变化
- 文献重现(2023年10月29日 周日)
- 煤炭的热解
- 讨论与答疑(2023年10月29日 周日)