AMS中分子动力学反应加速算法Replica Exchange

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时间 2021年3月18日(星期四)下午2点-2点45分

主讲人 刘俊

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培训简介

化学反应的分子动力学模拟中,反应发生的概率低,是这个领域中非常普遍存在的一个问题。化学反应发生,通常在宏观或较为介观时间尺度,而分子动力学模拟一般仅仅能模拟纳秒时间尺度。如何在纳秒时间尺度内,观察到化学反应在是分子动力学模拟中一个经常会遇到的难题。

Replica Exchange是一种促进反应事件发生的算法。通过在后台生成相同条件但温度更高的副本,在高温副本中检测到低温反应事件,而将该事件传递给低温副本,从而提高设定温度下,化学反应事件的发生概率。AMS中,所有引擎包括ADF、BAND、DFTB、MOPAC、ReaxFF的分子动力学模拟,均可使用Replica Exchange算法。