AMS中分子动力学反应加速算法Bond Boost

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时间 2021年3月11日(星期四)下午2点-2点45分

主讲人 刘俊

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培训简介

化学反应的分子动力学模拟中,反应发生的概率低,是这个领域中非常普遍存在的一个问题。化学反应发生,通常在宏观或较为介观时间尺度,而分子动力学模拟一般仅仅能模拟纳秒时间尺度。如何在纳秒时间尺度内,观察到化学反应在是分子动力学模拟中一个经常会遇到的难题。

Bond Boost是一种促进反应事件发生的算法。通过施加适当的外力,增大分子碰撞概率(或强行拉伸键长促使断裂),从而提高化学反应事件的发生概率。AMS中,所有引擎包括ADF、BAND、DFTB、MOPAC、ReaxFF的分子动力学模拟,均可使用Bond Boost算法。