ReaxFF：分子动力学、蒙特卡洛模拟化学反应

• AMS-ReaxFF包含哪些力场
• 用Advanced WF模块的ParAMS优化、训练ReaxFF力场
• ReaxFF在线英文手册
• ReaxFF2002版原始英文手册
• ReaxFF模拟的生成文件

• ReaxFF力场参数的含义是什么？
• ReaxFF常见问题及解决方式[目录]
• 没有相应力场怎么办？
• ReaxFF模拟的一些经验（更新中，欢迎贡献知识）

功能教程

• 【入门基础教程】晶体与表面计算的一些基础知识
• 【入门基础教程】NVT、NPT、NVE系综的设置
• 【入门基础教程】分子动力学模拟准备：弛豫
• ReaxFF-PES：势能面扫描
• 分子动力学中固定键长、键角的Shake用法
• 【入门基础教程】ReaxFF-燃烧：甲烷燃烧过程模拟、基元反应分析、反应速率常数计算、键级
• ReaxFF-Molecule Sink：反应过程中清除指定产物
• ReaxFF-Molecule Gun：模拟Ge(001)上的氧化铝薄膜CVD形成
• ReaxFF-NEB：搜索过渡态
• ReaxFF-聚合反应交联率：聚合反应的模拟与交联率的计算
• ReaxFF-GCMC：巨正则系综蒙特卡洛模拟
• ReaxFF-RDF：分析径向分布函数
• 通过径向函数描述扩撒均匀程度
• ReaxFF-温度分区：对不同分区设置不同温度
• ReaxFF-温度分布函数：计算沿着Cell某个轴向的温度分布函数
• ReaxFF-热导率方法1：T-NEMD方法结合温度分布
• ReaxFF-热导率方法2：T-NEMD方法结合传热功率统计
• ReaxFF-扩散系数：通过速度自相关函数或均方位移MSD，得到分析分子、原子的扩散系数
• ReaxFF-自由能的计算
• ReaxFF-表面吸附：模拟吸附过程、统计吸附产物
• eReaxFF-锂离子电池中碳酸乙烯酯（EC）分解的模拟
• ReaxFF-粘度：通过自相关函数与Green-Kubo公式计算粘度
• ReaxFF-弹性墙壁：添加外电场、弹性墙壁
• ReaxFF-NVE系综
• ReaxFF-应力张量的计算
• ReaxFF-在一定应力下的结构优化
• 复合模型（两块板间夹液体）的模拟
• AMS软件图像处理：线性回归拟合曲线斜率
• ReaxFF-切割过程/恒定速度冲击过程模拟：对特定区域原子施加速度/力/加速度
• 应力-应变曲线：断裂点

Python

• 用python统计ReaxFF轨迹中的分子个数、键、氢键、环的数目变化

反应加速

• REMD：加速分子动力学模拟中反应发生
• Bond Boost：加速分子动力学模拟中新键形成
• fbMC：加速分子动力学模拟中反应发生
• CVHD：加速分子动力学模拟中的裂解反应发生
• 纳米球形反应器：加速低温均相反应

案例

• 聚合物杨氏模量、屈服点、泊松比计算
• 使用ReaxFF中巨正则蒙特卡洛（GCMC）方法模拟锂硫电池锂化放电过程的电压特性
• 使用ReaxFF中巨正则蒙特卡洛（GCMC）方法模拟锂硫电池锂化放电过程的电压特性(视频)
• Li-S中Li离子的扩散系数：MSD法、VACF法，以及结合尔伦尼乌斯公式将扩散系数外推到低温
• 热固性聚合物的玻璃化转变温度
• 热固性聚合物的热膨胀系数
• ReaxFF模拟煤的热解
• 基于ReaxFF的团簇的生长模拟
• AMS软件：自动探索表面吸附位点
• AMS软件：自动探索表面化学反应机理案例-氧化物表面的水离解
• AMS软件：根据反应物、产物的分子结构，自动预测化学反应通道
• 基于 GCMC 预测吸附等温线：CO$_2$ 在 IRMOF-1 中的吸附

建模

• 【入门基础教程】创建固体表面，并均匀加入其它气体、液体分子
• 【入门基础教程】创建均匀混合物
• 【入门基础教程】创建高密度大分子固体、分子动力学压缩与拉伸

键级

AMSInput与Movie中的键级区别