ReaxFF-RDF:分析径向分布函数
建模与参数设置
在美国矿物学家晶体结构数据库可以搜索到体心立方铁的晶体结构文件,下载*.cif格式的结构文件。在ADFinput > File > Import Coordinates导入*.cif文件。
AMSinput > Edit > Crystal > Generate SuperCell,设置5*5*5的超胞。
参数设置:
结果查看
SCM > Movie > Graph > Delet gragh,删除默认的能量变化曲线,然后 MD Properties > RDF,弹出如下左边的对话框:
其中:
Name是生成的RDF函数曲线的名称
Steps设置起始、终止帧数,stepsize默认值即可。如果是计算静态结构的RDF,此处始、终Steps均设置为1即可
From Atoms,RDF计算中第一种原子,例如这里选择了所有的S原子,然后点+
To Atoms,RDF计算中第二种原子,例如这里选择了所有的Mo原子,然后点+,实际上第一种、第二种也可以是相同的
r range是RDF函数的范围,前两个框可以填入最大、最小值,如果不设置也会有默认值,或者设置delta也就是最大值、最小值之差也可以,不设置也可以。delta值比Cell晶格常数还大,程序会自动计算多个晶胞重复的情况
Generate按钮,生成RDF函数: