NOCV orbital、NOCV density、NOCV Def(ference) density的化学直观含义，参考：ETS-NOCV理论，尤其是ETS-NOCV方法将EDA（能量分解）中Orbital Interactions具体分解到不同轨道上

本例以MgO表面吸附CO为例，计算CO与MgO之间的化学价自然轨道。

本例是二维周期性体系与分子之间的相互作用，三维、一维周期性体系操作完全一致，只是Main菜单中Periodicity设置分别为Bulk（xyz三个方向具有周期性）、Chain（x方向具有周期性），而本例中二维周期性体系，设为Slab（xy方向具有周期性）。

代表性文献：

• 硅表面乙醚吸附－表面科学与分子有机化学共同点的最佳案例（Angew. Chem. Int. Ed., 2017）

二维表面的建模，参考从三维晶体切割出二维表面。

也可以从其它软件导入。可以使用VNL（免费，可以在费米科技官网在线申请），很轻松的创建石墨烯二维片层等模型，注意设置二维片层为轴方向。创建完毕之后，Export为CIF文件。ADFinput中，File > Coordinates Import导入，之后将Main菜单中Periodicity从Bulk（表示三维）改为Slab（表示二维）。这样表面建模就完成了。可以在上面添加分子。关于ADF软件建模的基本操作，参考：基本的建模功能（土豆视频）、聚合物的建模、设置默认显示晶体的周期数

不过本例中使用现成的坐标：

Mg       0.59538358       0.59538226       0.20750000
Mg       2.08384335      -0.89307752      -1.89750000
Mg      -2.38153597       0.59538226       0.20750000
Mg      -0.89307620      -0.89307752      -1.89750000
O        2.08384335      -0.89307752       0.20750000
O       -0.89307620      -0.89307752       0.20750000
O        0.59538358       0.59538226      -1.89750000
O       -2.38153597       0.59538226      -1.89750000
O        0.59538553       0.59539200       3.95250000
C        0.59538493       0.59538903       2.80750000
VEC1     2.97691955      -2.97691955       0.00000000
VEC2     2.97691955       2.97691955       0.00000000

拷贝上述内容，在ADFinput中CTRL V粘贴即可。

为了方便操作，最好只显示一个周期。

将CO和MgO设置为两个region，具体参考：如何创建分区

Numerical quality的设置在后面有，这里不需要设置。

此处只关心其化学性质，因此只需要计算Gamma点。

File > Save as保存任务，命名禁忌参考：软件运行故障及排除方法

参考：正式版的安装、维护与升级

在ADFinput窗口点击SCM LOGO > Output，点击Properties > PEDA-NOCV Energy Terms

各项意义，参考预备知识。E_tot一列就是该NOCV对能量分解（PEDA Energy Terms）中的E_orb的贡献，加起来等于PEDA Energy Terms中E_orb项的大小。

在ADFinput或者Output窗口点击： SCM LOGO > View > Fields → Grid → Fine, Add → Isosurface: With Phase

Fields → Grid → Fine, Add → Isosurface: With Phase

电子从红色区域流向蓝色区域。本例中，从CO流向MgO表面。

不过需要注意！NOCV都是成对出现的：alpha（上图中Spin列中所示字幕A）、beta（上图中Spin列中所示字幕B），也就是说，自动对AB进行了加和。

透明度设置为50%，这样能看清原子的同时，也能看清空间分布。

参考：如何从ADFinput、View、Movie等图形窗口导出图片

注意：

• SCM LOGO > View>Add>Isosurface>NOCV densities，显示NOCV的密度空间分布；
• SCM LOGO > View>Add>Isosurface: With Phase>NOCV Orbitals，显示NOCV轨道波函数的空间分布（包括两个相位都显示）；
• SCM LOGO > View>Add>Isosurface: With Phase>NOCV Def Densities，显示NOCV之间的密度差（例如NOCV_1**2表示第一个NOCV的模方，也就是密度），红色区域表示失去电子，蓝色区域表示得到电子。
• 所有的NOCV Def Densities加起来，就是形成吸附的过程中总的电子转移

这些量的含义，参考：ETS-NOCV理论、nocv-disdinguishbonding