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adf:buildpolymer

聚合物的建模

创建模型

以下以聚乙烯为例说明,使用AMS2019.301完成。

第一步:先创建两个单体,并使用MOPAC简单优化:

第二步:选中两个单体中的等价原子,从而测量聚合物重复单元的长度,例如本例,长度为252.3pm=2.523埃:

并将该方向设置为x轴:Edit - Align - With X-Axes,View - Axes可以查看坐标轴

第三步:删掉其他原子,只保留一个重复单元,并切换到DFTB、MOPAC,需要设置Main - Periodicity:Chain

第四步:修改晶格常数为2.523,菜单栏Bonds - Guess Bonds:

初步模型就创建好了。

优化模型

DFTB模块、MOAPC均可以优化,不过DFTB需要选择参数,MOPAC默认参数就可以。本例单胞太小,因此需要做超胞,这里只做二倍的超胞(Edit - Crystal - Generate Super Cell - 默认是2倍因此直接点OK)

保存任务,运行结束后,即可得到优化后的结构:

adf/buildpolymer.txt · 最后更改: 2019/12/09 11:22 由 liu.jun

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