adf:solvationmethod
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| adf:solvationmethod [2017/03/09 14:59] – [3D-RISM] liu.jun | adf:solvationmethod [2017/06/08 11:16] (当前版本) – [SCRF] liu.jun | ||
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| 行 17: | 行 17: | ||
| ADF软件有几十种内置溶剂，如果选择内置溶剂的话，这些参数内置了，不需要设置。 | ADF软件有几十种内置溶剂，如果选择内置溶剂的话，这些参数内置了，不需要设置。 | ||
| - | 这里面，没有考虑溶质对溶剂的反作用，从而导致溶剂的改变，从而反过来引发对溶质的作用的改变。这种互相影响达到平衡，叫做“自洽”。COSMO里面没有考虑自洽的效果。但如果溶质、溶剂的极性比较弱的话，这种自洽的效果就很弱，可以忽略。 | + | 这里面，没有考虑溶质对溶剂的反作用，导致溶剂的改变，从而反过来引发对溶质的作用的改变。这种互相影响达到平衡，叫做“自洽”。COSMO里面没有考虑自洽的效果。但如果溶质、溶剂的极性比较弱的话，这种自洽的效果就很弱，可以忽略。 |
| 参考：https:// | 参考：https:// | ||
| 行 25: | 行 25: | ||
| 参考：https:// | 参考：https:// | ||
| + | |||
| + | 因为SCRF要做自洽迭代的溶剂化，所以它的计算流程是： | ||
| + | * 计算一次溶质的SCF； | ||
| + | * 然后在溶质电子分布下，计算溶剂的情况； | ||
| + | * 在新的溶剂情况下，再计算一次溶质的SCF； | ||
| + | * 在新的溶质电子分布下，再计算溶剂的情况； | ||
| + | * …… | ||
| + | * 如此循环，直到溶剂、溶质的结果都几乎不再变动，即所谓收敛。 | ||
| + | |||
| + | 因此，一次SCRF溶剂化的单点计算或者片段分析，可能有很多个Bonding Energy（溶质的每一次SCF都会得到一次Boding Energy），看最后一个就是最终结果。 | ||
| + | |||
| + | SCRF不支持结构优化、Linear Transit、Transition State等。 | ||
| =====SM12===== | =====SM12===== | ||
| 行 41: | 行 53: | ||
| SM12模型对溶剂的描述比SCRF更精细。 | SM12模型对溶剂的描述比SCRF更精细。 | ||
| - | 参考：https:// | + | 英文手册：https:// |
| =====3D-RISM===== | =====3D-RISM===== | ||
| + | 使用非常多的经验参数详细描述溶剂的每个原子对溶质的影响，使用较为复杂。 | ||
| 参考：[[adf: | 参考：[[adf: | ||
| =====QMMM===== | =====QMMM===== | ||
| + | 溶剂的影响不再单纯考虑为均匀介质，会考虑溶剂原子的电荷、偶极电荷甚至四极电荷的影响。 | ||
| 参考：[[adf: | 参考：[[adf: | ||
| 行 54: | 行 66: | ||
| FDE方法支持将计算的区域分为两个或多个区域，可以分别设置某个区域精确计算，某些区域作为“环境”，但“环境”本身也使用DFT计算得到。 | FDE方法支持将计算的区域分为两个或多个区域，可以分别设置某个区域精确计算，某些区域作为“环境”，但“环境”本身也使用DFT计算得到。 | ||
| - | 参考：https:// | + | 参考： |
| + | * [[adf: | ||
| + | * 英文手册：https:// | ||
adf/solvationmethod.1489042775.txt.gz · 最后更改: 2017/03/09 14:59 由 liu.jun