adf:pesexploration

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--- adf:pesexploration [2022/11/14 11:44] – [参数设置] liu.jun
+++ adf:pesexploration [2024/05/13 11:06] (当前版本) – [人工智能：自动探索表面吸附位点] liu.jun
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-======表面吸附位点探索======
+======AMS软件：自动探索表面吸附位点======
-模型：二维周期性体系表面吸附小分子或原子团簇，本功能适用版本为AMS2022。
+  * 版本：本功能适用版本为AMS2022。
+  * 模块：这里以ReaxFF模块为例，其他模块的使用，除Main窗口参数设置不同之外，其他一致，因此可以用于DFTB、MOPAC、BAND。
+  * 模型：二维周期性体系表面吸附小分子或原子团簇，本例仅以O原子为例。
+  * 周期性：本功能要求建模完成后，先Edit → Crystal → Map Atoms to (0..1)，否则与Movie中坐标不一致。
 =====参数设置=====
 将体系分为两个region，Slab与吸附区域（下图所示region名为active）:
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 {{ :adf:pesexploration02.png?650 }}
-设置探索参数，探索次数和探索“人数”，每个人次数越多、人数越多，则计算量时间越长，也越全面，当然这跟体系表面的大小也有直接关系
+设置探索参数，探索次数和探索“人数”，每个人次数越多、人数越多，则计算量时间越长，也越全面，当然这跟体系表面的大小也有直接关系，例如此次可以改为40/8
 {{ :adf:pesexploration03.png?650 }}
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 {{ :adf:pesexploration04.png?650 }}
-探索时移动的小分子或原子簇，此处为active这个region，适当提高max energy，能增大搜索范围
+探索时移动的小分子或原子簇，此处为active这个region，适当提高max energy例如到30eV，能大幅度增大搜索范围
 {{ :adf:pesexploration05.png?650 }}
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 {{ :adf:pesexploration06.png?650 }}
-计算过程，或者计算完毕，在SCM → Movie中可以看到探索的各种吸附位点，并在右侧显示每个编号的位点的能量。能量最低的，一般拍在第一帧：
+计算过程，或者计算完毕，在SCM → Movie中可以看到探索的各种吸附位点，并在右侧显示每个编号的位点的能量。能量最低的，一般拍在第一帧，后面的帧能量依次增大。有一些报错信息可以忽略（这是搜索过程中某些搜索行为失败而生成的），只要Movie中有相应结果即可。
 {{ :adf:pesexploration07.png?650 }}
+任意一帧结构均可File → save geometry或Update Geometry in Input，保存为xyz格式文件或更新到AMSinput窗口。
+=====关于PES Exploration的更多技巧=====
+{{ :adf:whatsnewams2023-aguirre.pdf |参考资料pdf下载}}

adf/pesexploration.1668397499.txt.gz · 最后更改: 2022/11/14 11:44 由 liu.jun

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