adf:pbsorlsf
差别
这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:pbsorlsf [2022/11/13 10:31] – [注意：] liu.jun | adf:pbsorlsf [2023/07/21 12:36] (当前版本) – [2，如果集群可以使用GUI] liu.jun | ||
|---|---|---|---|
| 行 2: | 行 2: | ||
| =====注意：===== | =====注意：===== | ||
| - | * 每个集群脚本完全不同，以下范例，仅供参考，请勿照抄。 | + | |
| =====一、LSF系统===== | =====一、LSF系统===== | ||
| ====1，脚本样本==== | ====1，脚本样本==== | ||
| 行 31: | 行 31: | ||
| mv ams.results ${JOBNAME}.results | mv ams.results ${JOBNAME}.results | ||
| mv logfile ${JOBNAME}.logfile | mv logfile ${JOBNAME}.logfile | ||
| + | mv * ../ | ||
| + | cd .. | ||
| + | rm -rf ${JOBNAME} | ||
| </ | </ | ||
| 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内，并在上述脚本文件中 | 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内，并在上述脚本文件中 | ||
| 行 62: | 行 65: | ||
| JOBNAME= | JOBNAME= | ||
| - | cat $PBS_NODEFILE > machinefile | ||
| dos2*unix ./ | dos2*unix ./ | ||
| chmod 700 ./ | chmod 700 ./ | ||
| + | mkdir ${JOBNAME} | ||
| + | mv ./ | ||
| + | cd ${JOBNAME} | ||
| mkdir / | mkdir / | ||
| export SCM_TMPDIR=/ | export SCM_TMPDIR=/ | ||
| 行 71: | 行 76: | ||
| mv ams.results ${JOBNAME}.results | mv ams.results ${JOBNAME}.results | ||
| mv logfile ${JOBNAME}.logfile | mv logfile ${JOBNAME}.logfile | ||
| + | mv * ../ | ||
| + | cd .. | ||
| + | rm -rf ${JOBNAME} | ||
| </ | </ | ||
| 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内，并在上述脚本文件中< | 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内，并在上述脚本文件中< | ||
| 行 82: | 行 90: | ||
| 说明如下： | 说明如下： | ||
| - Queue Name：可以根据用户习惯设置，用于提醒用户这个队列的特征，不能包含中文、空格 | - Queue Name：可以根据用户习惯设置，用于提醒用户这个队列的特征，不能包含中文、空格 | ||
| - | - Remote host：必须填写localhost，即在本节点提交作业（到集群其他计算节点） | + | - Remote host：必须填写localhost，即在本节点提交作业（到集群其他计算节点），当然也可以写登录节点的IP或者其他机器名 |
| - Remote job directory：作业存放路径，这个可以较为灵活设置，一般不影响使用，因为实际使用过程中，仍然可以选择存储在任何其他路径中 | - Remote job directory：作业存放路径，这个可以较为灵活设置，一般不影响使用，因为实际使用过程中，仍然可以选择存储在任何其他路径中 | ||
| - Run command：原则上这里汇集了PBS脚本的前几行的信息，照抄即可，最后是“ $job”结尾 | - Run command：原则上这里汇集了PBS脚本的前几行的信息，照抄即可，最后是“ $job”结尾 | ||
| - Prolog command：用source语句读取软件中的amsbashrc.sh文件，使得环境变量生效 | - Prolog command：用source语句读取软件中的amsbashrc.sh文件，使得环境变量生效 | ||
| + | |||
| + | |||
| =====三、SLURM系统===== | =====三、SLURM系统===== | ||
| 参考：[[adf: | 参考：[[adf: | ||
| **如果运行有问题，可以咨询ams@fermitech.com.cn。** | **如果运行有问题，可以咨询ams@fermitech.com.cn。** | ||
adf/pbsorlsf.1668306710.txt.gz · 最后更改: 2022/11/13 10:31 由 liu.jun