QuantumATK的硬件需求
概述
原则上,QuantumATK可以运行于绝大多数配置较新的计算机上,操作系统可以是Windows、Linux、MacOS系统上;
QuantumATK可以运行于笔记本电脑上,但对复杂体系进行计算和显示可能消耗很大的计算和图形显示资源;
理想的运行计算的平台可以是集群或性能好的工作站。建议使用较新的64位处理器并且在Linux系统下并行运行64位版本的QuantumATK。计算通常并不需要很多节点,在3-4个节点上并行即可获得明显的速度提升。QuantumATK还可以充分利用多核计算。
小体系(通常100原子以下)可以在笔记本电脑上运行,并且可以并行提速。并行计算可以运行在Linux和Windows系统上,但在Mac上不能并行。
VNL的图形界面应该运行在有硬件加速的显卡的计算机上。通常nVIDIA、ATI显卡的3D图形性能更好,Intel HD系列的的集成显卡也可以,但应该正确安装厂商提供的显卡驱动,例如Linux下不要使用Mesa等开源驱动。
QuantumATK的平台适应能力很强,在安装时很少遇到奇怪的问题。
CPU
QuantumATK可以运行在以下两种平台上:
i686:符合IA32架构的处理器,支持MMX和SSE指令集,包括有以下几种32位和64位的处理器
Intel:Pentium III, Pentium 4, Pentium M, Pentium D, Celeron M, Xeon, Pentium 4 EM64T, Xeon EM64T, Core Solo/Duo, Core 2 Solo/Duo/Quad/Extreme,等;
AMD: Athlon XP, Athlon MP, Athlon 64, Athlon 64 X2, Opteron, Duron, Sempron, Turion, 等。
86_64:64位处理器,主要指EM64T和AMD64类型,例如:
Intel:Pentium 4 EM64T, Xeon EM64T, Pentium D, Core 2 Solo/Due/Quad/Extreme, 等;
AMD:Operon,Athlon 64,Turion 64,等。
推荐使用64位的系统,从2017开始,QuantumATK将不再支持32位系统。
内存
QuantumATK计算对内存的需求依赖于要计算的体系和计算参数的选择。运行QuantumATK官网提供的教程实例,最少需要2GB的物理内存;运行大多数计算(最多大于500个原子)大约需要4GB内存。需要注意的是,某些参数选择可能会显著增加内存需求。
硬盘空间
QuantumATK在计算过程中会使用临时文件,计算结果的保存也需要硬盘空间。推荐至少 2GB 以上可用空间用于安装软件,保存数据则根据计算作业量多少变化。
图形显示
QuantumATK的图形界面VNL支持高级3D图形显示,为了获得更加的显示效果和操作体验,除了采用较高级的计算机处理器和内存外,建议采用高级的图形卡。推荐使用带有3D硬件加速的显卡,并安装显卡生产商提供的最新的驱动程序。
VNL需要OpenGL和Shader technology来快速渲染原子和电子结构。
网络
运行QuantumATK软件需要启用最少一个网卡(不需联网),以便绑定license。
并行环境
操作系统相关
所有较新版本的操作系统(Windows、Linux、MacOS)都可以运行QuantumATK,推荐使用较新版本的Linux系统用于计算。
Linux系统相关
推荐使用长期维护(LTS)的Linux发行版。
注意:CentOS/RedHat 需要6.0版本以上才能正常运行QuantumATK。
Linux系统库关联
QuantumATK动态链接到以下库:
libatk-1.0.so.0
libcairo.so.2
libcrypt.so.1
libc.so.6
libdb-4.7.so
libdl.so.2
libfontconfig.so.1
libfreetype.so.6
libgcc_s.so.1
libgdbm.so.2
libgdk_pixbuf-2.0.so.0
libgdk-x11-2.0.so.0
libgio-2.0.so.0
libglib-2.0.so.0
libGL.so.1
libGLU.so.1
libgmodule-2.0.so.0
libgobject-2.0.so.0
libgthread-2.0.so.0
libgtk-x11-2.0.so.0
libICE.so.6
libjpeg.so.62
libm.so.6
libncurses.so.5
libncursesw.so.5
libnsl.so.1
libpanelw.so.5
libpango-1.0.so.0
libpangocairo-1.0.so.0
libpangoft2-1.0.so.0
libpng12.so.0
libpthread.so.0
librt.so.1
libSM.so.6
libstdc++.so.6
libutil.so.1
libX11.so.6
libX11-xcb.so.1
libxcb.so.1
libXext.so.6
libXft.so.2
libXi.so.6
libXmu.so.6
libXrender.so.1
libz.so.1