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adf:linuxworkstation_root

单个Linux工作站:安装、获取机器码、申请锁定license、安装license

AMS软件本身并不区分正式版、试用版。对于试用版和正式版的区分,是在license文件,以及法律意义的授权协议上面。因此无论是试用版还是正式版,安装过程都是按照如下步骤(以2022.103版为例,其他版本类似)。

不要在虚拟系统、子系统中安装,运行会不正常。

第一步,解压软件

将安装包上传到在目标文件夹(例如/opt),并中解压AMS安装包:

cd /opt
tar zxf ./ams2022.103.pc64_linux.intelmpi.bin.tgz (当然不同的版本,这个文件名也不同)

这样会生成文件夹/opt/ams2022.103。然后执行命令:

chmod 755 -R /opt/ams20*.*

从而赋予该文件夹适当权限:普通用户可以运行程序,但不能修改程序文件。

第二步,设置环境变量

在解压生成的AMS2022.103目录内,有一个文件,名为amsbashrc.sh,里面包含了AMS所需的环境变量。用户可以酌情考虑是否将临时文件夹从/tmp更改为作业所在文件夹,如果需要,则在该文件最后增加一行:

export SCM_TMPDIR=$PWD
  • SCM_TMPDIR所指向的这个目录要注意经常清理,避免大量垃圾堆积;

如果是ReaxFF用户,还建议增加一行:

export OMP_NUM_THREADS=1

第三步,使环境变量生效

source /opt/ams2022.103/amsbashrc.sh
export SCM_OPENGL_SOFTWARE=1

将这两行写入/etc/profile尾部,安装完毕,重启机器,普通用户就不需要设置环境变量了。

第四步,获取机器码(用于申请license)

在命令行执行命令:

dirac info

即弹出AMS所需的机器码,将其文本拷贝下来。如果购买了多台工作站的license,在每台安装的工作站上都这样操作,获取机器码。

第五步,提交机器码

提交机器码:由注册人邮箱将机器码发送给费米科技(ams@fermitech.com.cn或相关人员),用于license的申请。邮件内容中请说明:单位、注册人、“申请正式许可”。如果不是注册人本人提交,需要抄送给注册人邮箱一般提交机器码之后,1~3工作日内会把license发给您,如果3天仍然没有收到,您可以联系我们查询一下进度。

第六步,安装license

用户收到license.txt文件之后,将该文件放置在AMS安装文件夹(如AMS2022.103)中,之后即可正常使用。安装过程中有任何问题,可以发邮件到ams@fermitech.com.cn,说明尽量全面的报错的信息,我们将提供有效的协助。

第七步,修改图形界面的默认设置

如果这台服务器需要用作图形显示,则可以进行如下设置,否则可以跳过。图形界面的一些默认设置可能并不是我们想要的,例如背景色等。主要的几个可能修改的配置:

  • 背景色改为纯白色:SCM LOGO > Preference > Colors > Colors:将Background color top和Background color buttom均改为白色,这样背景色就成为白色了
  • 立体视角(远小近大的显示方式)改为平行视角(远近一样大):SCM LOGO > Preference > Options > General > Use perspective: No
  • 修改波函数等图形分辨率(这个必须修改,否则显示的波函数、静电势等等空间分布函数图不够细腻):SCM LOGO > Preference > Module > AMSview > Grid: Fine

用户还可以根据自己的使用习惯,在Preference窗口修改其他默认设置。这些设置是全局生效的,也就是说修改之后,以后打开的窗口都生效。另外,用户还可以SCM LOGO > Preference > Colors > Atom Colors 修改原子的颜色等等

第八步,正确设置Queue,合理利用CPU资源(非常重要)

初级用户,为了避免资源浪费,事半功倍,请务必花几分钟时间阅读:Linux、Windows桌面系统:使用图形界面提交任务、指定任务核数

adf/linuxworkstation_root.txt · 最后更改: 2024/05/23 15:37 由 liu.jun

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