分子建模:
周期性体系建模:
一般而言晶体的结构,我们从头创建是非常困难的,因此大多数情况下,我们会从各种晶体结构数据库中下载一些相似晶体结构的*.cif文件,在其基础上进行修改。免费开放的晶体结构数据库:Crystallography Open Database、美国矿物学家晶体结构数据库。
反应分子动力学体系建模(图形化操作界面集成Packmol程序,自动生成随机结构):
精细操控位置