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adf:gcmc2020

这是本文档旧的修订版!


ReaxFF-GCMC:巨正则系综蒙特卡洛模拟

建模

View - Periodic - Show Unit Cell:

点击底部四边形按钮,切出表面:

Edit - Crystal - Generate Super Cell,生成超胞3*3。

参数设置

周期性这里是Slab(二维周期性,上下表面外部为半无限大真空),需要改为Bulk,并在Model - Latice中设置适当的Z方向高度:

Task选择GCMC:

然后点击GCMC右侧的>按钮,详细设置GCMC参数。点击Molecules前面的+,可以增加一种粒子源,这里只设置一种。Molecule下拉菜单选择New Molecule,左侧窗口增加了一个,用户可以将粒子创建在该窗口中。窗口底部的Mol-1、Mol-2可以切换:

用户还需要设定:

  • 系综(Mμ-VT化学势、体积、温度恒定,Mμ-PT化学势压强温度恒定)
  • MC的步数,这里设定为30000
  • 温度,这里设置1500K。
  • Chemical Potential,这里设置为-0.4736 Hartree(后面的单位是可以更改的)。

原子化学势的计算

如果粒子源是原子,那么原子的化学势可以用统计力学从第一原理推导出来,或者从文献资料中的热化学表中查询。单个氧原子的化学势等于同温度压强下$O_2$化学势的1/2。化学势计算公式:

  • μ$_{O2}^{ref}$(T,P$_{ref}$)是$O_2$在温度T、压强P$_{ref}$下的化学势
  • k为波尔兹曼常数,T为温度
  • P是$O_2$的分压。如果只有$O_2$一种气体,那么kT*ln(P/P$_ref$)=kT*ln1=0
  • E$_{O2}^{diss}$是分子的解离能,也就是分子解离为原子所需的能量(正值)

结果查看

在movie中可以看到Si的氧化结果:

adf/gcmc2020.1606391690.txt.gz · 最后更改: 2020/11/26 19:54 由 liu.jun

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