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adf:coskf2020

这是本文档旧的修订版!


如何准备*.coskf文件

*.coskf文件是进行COSMO-RS模拟所需要的(溶质分子、溶剂分子)文件,例如NaCl水溶液,就分别需要Na+、Cl-、H2O的*.coskf文件。对于离子液体,就分别计算阳离子、阴离子,得到各自的*.coskf文件。

SCM LOGO > COSMO-RS进入流体热力学模块,默认情况下,会提示到官网下载分子库文件。该分子库包含1872种分子的*.coskf文件。如果我们要计算的(溶质、溶剂)分子,这个库里面没有,那么就需要我们自己通过ADF模块准备。过程非常简单:

创建分子

建模的操作,参考:AMS软件建模教程

设置参数

AMSinput > Main > Task > COSMO-RS Compound,则所有相关的参数都自动选好了。唯独需要调整的是:

  • Total Charge:分子是否带电。例如H3O+带电为1、OH-带电为-1
  • Spin Polarizaition:自旋极化。也就是有多少个电子没有配对,N重态的自旋极化值=N-1。如果需要设置该项,需要勾选Unrestricted。

例如,H3O+的分子的参数:

File > Save as保存任务,之后提交任务。软件的并行计算,参考正式版的安装、维护与升级

得到文件

计算完毕之后,任务所在文件夹里面,就有了*.coskf文件供COSMO-RS模块使用。

使用该*.coskf文件

SCM LOGO > COSMO-RS打开COSMO-RS模块。在COSMO-RS窗口点击Compounds > Add Compound(s) 添加前面生成的*.coskf文件(注意更改“文件选择窗口”右下角,文件类型为coskf,不然可能找不到。

有的情况,需要补充数据

添加完毕之后,窗口会列出所有导入的分子,对某些性质计算(具体可以参考相应的教程),用户需要为这些分子添加更精细的实验参数:

  1. 选中某个分子,右边会列出该分子的性质,下方Input Data中,例如Nring(芳香环原子个数)等;
  2. 对溶解度(尤其是固溶体系)来说,熔点(Melting point,Δ_fusion H, Δ_fusion Cp)的数值非常重要;
  3. 在没有实验数据的情况下,使用“Generate”按钮,程序会估计出一个数值来(在没有实验数据的情况下,强烈推荐该按钮);
  4. 计算蒸汽压、气液相平衡、共沸等性质时,需要填写或猜测蒸汽压方程数据。

之后,Ctrl s保存任务,然后就可以进行具体某项性质的计算了。具体计算方法,参考相应教程。

adf/coskf2020.1683953803.txt.gz · 最后更改: 2023/05/13 12:56 由 liu.jun

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