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atk:石墨烯-镍界面 [2018/05/23 17:14] – [更多构形] xie.congwei | atk:石墨烯-镍界面 [2018/06/15 10:15] (当前版本) – [石墨烯-镍界面] fermi |
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**链接:** [[https://journals.aps.org/prb/abstract/10.1103/PhysRevB.85.165442|K. Stokbro et al., PRB 85, 165442 (2012)]] | **链接:** [[https://journals.aps.org/prb/abstract/10.1103/PhysRevB.85.165442|K. Stokbro et al., PRB 85, 165442 (2012)]] |
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ATK可以轻松地处理如上所述出版物所涉及的含有两个不同电极的异构体系。在本教程,您将学习如何构建一个类似的体系。 | ATK可以轻松地处理如上面文章所涉及的含有两个不同电极的异构体系。在本教程,您将学习如何构建一个类似的体系。 |
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| <WRAP center info 100%> |
| === 提示 === |
| **本教程使用特定版本的QuantumATK创建,因此涉及的截图和脚本参数可能与您实际使用的版本略有区别,请在学习时务必注意。** |
| </WRAP> |
===== 创建结构 ===== | ===== 创建结构 ===== |
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** | * **步骤 1:**点击 Add {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Add from Database,在数据库中搜索并选中镍,添加到 Stash。然后从晶体数据库中将石墨烯也添加到 Stash。 |
步骤 1:**点击 Add {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Add from Database,在数据库中搜索并选中镍,添加到 Stash。然后从晶体数据库中将石墨烯也添加到 Stash。 | |
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{{ :atk:snap13.png?800 |}} | {{ :atk:snap13.png?800 |}} |
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**步骤 2:**石墨烯和 Ni(111) 面匹配的很好,这也正是我们考虑的界面。采用切割工具 Builders {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Surface (Cleave) 沿晶体 (111) 面切成一个 3 层电极晶胞。 | * **步骤 2:**石墨烯和 Ni(111) 面匹配的很好,这也正是我们考虑的界面。采用切割工具 Builders {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Surface (Cleave) 沿晶体 (111) 面切成一个 3 层电极晶胞。 |
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**步骤 3:**打开 Builders {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Interface 创建两体系间的界面。分别将 Ni(111) 构形和石墨烯拖至第一个和第二个插槽。 | * **步骤 3:**打开 Builders {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Interface 创建两体系间的界面。分别将 Ni(111) 构形和石墨烯拖至第一个和第二个插槽。 |
| * **步骤 4:**推荐选用可反映晶格对称性的最小晶胞。该晶胞为六角对称性,但对于本例的计算,使用矩形晶胞会更方便。因此,请单击 **Select Surface Cells**,然后选取原子数稍大但单元相同的晶胞,如下图所示。可点击左下角图中对应的点来选中该晶胞。 |
**步骤 4:**推荐选用可反映晶格对称性的最小晶胞。该晶胞为六角对称性,但对于本例的计算,使用矩形晶胞会更方便。因此,请单击 Select Surface Cells,然后选取原子数稍大但单元相同的晶胞,如下图所示。可点击左下角图中对应的点来选中该晶胞。 | * **步骤 5:**点击 **Shift Surfaces**,在 Z 的位置上增加至 2 Å。 |
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**步骤 5:**点击 Shift Surfaces,在 Z 的位置上增加至 2 Å。 | |
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**步骤 6:**用 Bulk Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Repeat,沿 **B** 方向上扩胞至 12 倍以在扩展的 Ni(111) 界面上结合更大的石墨烯片。 | * **步骤 6:**用 Bulk Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Repeat,沿 **B** 方向上扩胞至 12 倍以在扩展的 Ni(111) 界面上结合更大的石墨烯片。 |
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{{ :atk:snap42.png?800 |}} | {{ :atk:snap42.png?800 |}} |
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**步骤 7:**打开 Selection Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} By Expression,输入** e = Ni and b > 0.5**。按下 Enter 或Tab 键,以及 Delete 键。该操作将会切掉 Ni 平板的一半。 | * **步骤 7:**打开 Selection Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} By Expression,输入** e = Ni and b > 0.5**。按下 Enter 或Tab 键,以及 Delete 键。该操作将会切掉 Ni 平板的一半。 |
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{{ :atk:snap52.png?800 |}} | {{ :atk:snap52.png?800 |}} |
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**步骤 8:**确定您想要的镍-石墨烯界面是多大,然后用鼠标选中、删除多余的碳原子。 | * **步骤 8:**确定您想要的镍-石墨烯界面是多大,然后用鼠标选中、删除多余的碳原子。 |
| * **步骤 9:**如果您想使边缘碳原子的悬挂键饱和(请参阅文章 — 您可能想,也可能不想这样做),选中缘原子并使用钝化工具 {{:atk:passivate02.png?25|}} 。 |
**步骤 9:**如果您想使边缘碳原子的悬挂键饱和(请参阅文章 — 您可能想,也可能不想这样做),选中缘原子并使用钝化工具 {{:atk:passivate02.png?25|}} 。 | * **步骤 10:**由于输运方向始终是沿着 Z 方向,体系需要重新调整。采用 Bulk Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Swap Axes,选择** B<->C** 和 **Y<->Z** 切换轴的方向(通常您应该总是交换两次以获得一个右手体系)。 |
| * **步骤 11:**最后,使用 Device Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Device From Buik 将结构转换为器件构形;默认选项就可以,所以只需点击 OK 即可。 |
**步骤 10:**由于输运方向始终是沿着 Z 方向,体系需要重新调整。采用 Bulk Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Swap Axes,选择** B<->C** 和 **Y<->Z** 切换轴的方向(通常您应该总是交换两次以获得一个右手体系)。 | |
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**步骤 11:**最后,使用 Device Tools {{:atk:arrow.png?direct&5|}} Device From Buik 将结构转换为器件构形;默认选项就可以,所以只需点击 OK 即可。 | |
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===== 参考 ===== | ===== 参考 ===== |
* 英文原文:[[http://docs.quantumwise.com/tutorials/graphene_nickel.html|http://docs.quantumwise.com/tutorials/graphene_nickel.html]] | * 英文原文:[[http://docs.quantumwise.com/tutorials/graphene_nickel.html|http://docs.quantumwise.com/tutorials/graphene_nickel.html]] |
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====== 视频 ====== | |
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