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atk:使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤

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atk:使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤 [2016/09/28 08:39] – [输入文件] nie.hanatk:使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤 [2018/08/12 16:09] (当前版本) – [开始新的计算] fermi
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-====== 使用VNL-ATK进行计算模拟的一般操作步骤 ======+====== 使用QuantumATK进行计算模拟的一般操作步骤 ======
  
  
 ===== 计算中涉及的文件 ===== ===== 计算中涉及的文件 =====
 ==== 输入文件 ==== ==== 输入文件 ====
-VNL-ATK计算的输入文件是一个 Python(什么是Python语言?)格式的计算脚本(Script),文件通常命名为“''*.py''”。计算脚本中通常包含两个部分:模型的几何结构信息;要进行的计算流程。+QuantumATK计算的输入文件是一个 Python(什么是Python语言?)格式的计算脚本(Script),文件通常命名为“''*.py''”。计算脚本中通常包含两个部分:模型的几何结构信息;要进行的计算流程。
 === 创建计算脚本 === === 创建计算脚本 ===
 VNL中提供的Script Generator是创建计算脚本的最佳方式,使用这个方法可以快速的设置计算。 VNL中提供的Script Generator是创建计算脚本的最佳方式,使用这个方法可以快速的设置计算。
行 18: 行 18:
 ==== 输出文件 ==== ==== 输出文件 ====
  
-VNL-ATK将所有计算结果的详细数据都保存在一个NetCDF文件中,文件的扩展名默认为“''.nc''”。+QuantumATK将所有计算结果的详细数据都保存在一个HDF5格式文件中,文件的扩展名默认为“''.hdf5''”。(从2018版开始QuantumATk不再支持NetCDF/nc文件的写操作,但支持读入操作)
  
-=== 如何读取nc文件中的数据 === +=== 如何读取hdf5文件中的数据 === 
-  * nc文件是二进制文件,其中的数据可以在VNL图形界面中查看,无法用文本编辑器打开。 +  * hdf5 件是二进制文件,其中的数据可以在 NanoLab 图形界面中查看,无法用文本编辑器打开。 
-  * nc文件中的数据除了在VNL直接查看并可视化之外,还可以使用VNL-ATK 提供的Python工具读取并导出。+  * hdf5 文件中的数据除了在 NanoLab 直接查看并可视化之外,还可以使用 QuantumATK 提供的 Python 工具读取并导出。
  
-=== log文件 ===+=== log 文件 ===
  
-VNL-ATK会将计算过程的概要信息输出到标准输出。用户可以将log信息重定向至指定的文件,以备查看。log文件中通常包含重要的提示、警告和错误信息,对于判断计算过程是否正常十分重要。+QuantumATK会将计算过程的概要信息输出到标准输出。用户可以将 log 信息重定向至指定的文件,以备查看。log 文件中通常包含重要的提示、警告和错误信息,对于判断计算过程是否正常十分重要。
  
 ===== 开始新的计算 ===== ===== 开始新的计算 =====
  
-和很多其他的计算模拟工具一样,VNL-ATK提供了一整套方便易用的工具,涵盖模型构建、计算设置、计算任务提交和管理、结果分析与可视化等所有必备的功能。+和很多其他的计算模拟工具一样,QuantumATK提供了一整套方便易用的工具,涵盖模型构建、计算设置、计算任务提交和管理、结果分析与可视化等所有必备的功能。
  
 基本步骤: 基本步骤:
-  - 使用**Builder**进行模型构建;+  - 使用**DataBase**和**Builder**进行结构搜索和模型构建;
   - 使用**Script Generator**与**Script Editor**进行计算设置;   - 使用**Script Generator**与**Script Editor**进行计算设置;
   - 使用**Job Manager**进行计算任务提交和管理;   - 使用**Job Manager**进行计算任务提交和管理;
atk/使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤.1475023199.txt.gz · 最后更改: 2016/09/28 08:39 由 nie.han

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