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adf:workstationwithoutgui

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adf:workstationwithoutgui [2018/11/22 11:02] liu.junadf:workstationwithoutgui [2024/03/21 11:36] (当前版本) liu.jun
行 1: 行 1:
-=====没有图形界面的工作站、没有PBS或LSF的集群:直接运行*.run文件===== +=====无桌面的Linux工作站:直接运行*.run文件、设定任务核数===== 
-*表示文件名,下同。+=====第一节:操作方式===== 
 +***表示文件名,下同。**
  
   * 上传*.run文件到//任务目录//   * 上传*.run文件到//任务目录//
-  * 进入某个计算节点,例如:ssh node01+  * 进入某个计算节点,例如:ssh node01。当然如果只有一个服务器,这一步也就不需要了。
   * cd //任务目录//   * cd //任务目录//
-  * dos2unix *.run (如果上传*.run文件使用的是SSH Secure Shell,那么在SSH Secure Shell的edit>setting>File transfer>Mode里面Auto Select一项,双击txt,修改成run。那么这一步以后就永远可以跳过了)+  * dos2unix *.run (如果上传*.run文件使用的是SSH Secure Shell软件,那么在SSH Secure Shell的菜单栏edit>setting>File transfer>Mode里面Auto Select一项,双击txt,修改成run。那么这一步以后就永远可以跳过了)
   * chmod 700 *.run   * chmod 700 *.run
   * export NSCM=N <color green>(N表示您希望的并行数,如果不设置则调用本机所有CPU核。如果是浮动许可,例如8核浮动,则必须设置这个变量,并且N不大于8)</color>   * export NSCM=N <color green>(N表示您希望的并行数,如果不设置则调用本机所有CPU核。如果是浮动许可,例如8核浮动,则必须设置这个变量,并且N不大于8)</color>
   * nohup ./*.run >*.out &   * nohup ./*.run >*.out &
   * ctrl d退出,之后再关闭命令行窗口。注意,如果不按ctrl d退出,直接关闭命令行窗口,则任务也自动被关闭。   * ctrl d退出,之后再关闭命令行窗口。注意,如果不按ctrl d退出,直接关闭命令行窗口,则任务也自动被关闭。
-  * 监测计算进度:tail -f /目标文件夹/logfile+  * 监测计算进度:tail -f /目标文件夹/*.results/ams.log
  
 这些命令的学习,参考:[[adf:commandinlinux]] 这些命令的学习,参考:[[adf:commandinlinux]]
  
-运行完毕之后:修改logfile为*.logfile,TAPE21改名为*.t21,out改名为*.out。之后下载到本地Windows电脑,或者其他有图形界面的电脑上进行分析。+运行完毕之后: 
 +将ams.results文件夹改名为*.results 
 + 
 +之后下载到本地Windows电脑,或者其他有图形界面的电脑上进行分析。
  
 **强烈地不建议多个任务在同一个文件夹里面进行,而应该为每个任务创建一个文件夹。** **强烈地不建议多个任务在同一个文件夹里面进行,而应该为每个任务创建一个文件夹。**
  
 如果任务是进行片段分析,参考:[[adf:submitfragment_lsf]] 如果任务是进行片段分析,参考:[[adf:submitfragment_lsf]]
 +
 +=====第二节:如何正确、高效利用计算机资源(重要)=====
 +参考:[[adf:effofparal]]
adf/workstationwithoutgui.1542855723.txt.gz · 最后更改: 2018/11/22 11:02 由 liu.jun

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