用户工具

站点工具


adf:workstationwithoutgui

无桌面的Linux工作站:直接运行*.run文件、设定任务核数

*表示文件名,下同。

  • 上传*.run文件到任务目录
  • 进入某个计算节点,例如:ssh node01。当然如果只有一个服务器,这一步也就不需要了。
  • cd 任务目录
  • dos2unix *.run (如果上传*.run文件使用的是SSH Secure Shell软件,那么在SSH Secure Shell的菜单栏edit>setting>File transfer>Mode里面Auto Select一项,双击txt,修改成run。那么这一步以后就永远可以跳过了)
  • chmod 700 *.run
  • export NSCM=N (N表示您希望的并行数,如果不设置则调用本机所有CPU核。如果是浮动许可,例如8核浮动,则必须设置这个变量,并且N不大于8)
  • nohup ./*.run >*.out &
  • ctrl d退出,之后再关闭命令行窗口。注意,如果不按ctrl d退出,直接关闭命令行窗口,则任务也自动被关闭。
  • 监测计算进度:tail -f /目标文件夹/logfile

这些命令的学习,参考:Linux常用命令

运行完毕之后: 将ams.results文件夹改名为*.results

之后下载到本地Windows电脑,或者其他有图形界面的电脑上进行分析。

强烈地不建议多个任务在同一个文件夹里面进行,而应该为每个任务创建一个文件夹。

如果任务是进行片段分析,参考:Linux系统中,片段分析如何使用run文件提交任务

adf/workstationwithoutgui.txt · 最后更改: 2022/10/28 15:15 由 liu.jun

© 2014-2022 费米科技(京ICP备14023855号