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adf:vandervaarssurfacepotential

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adf:vandervaarssurfacepotential [2020/08/12 14:16] – 创建 liu.junadf:vandervaarssurfacepotential [2023/06/14 15:40] (当前版本) – [结果查看] liu.jun
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-======如何显示范德华表面的静电势分布======+======如何显示分子体系范德华表面的静电势分布======
 首先,范德华表面的定义,如果参考文献(J. Am. Chem. Soc. 1987, 109,7968-7979)的定义,则可以选为电子云密度等值面的值为0.001的曲面。 首先,范德华表面的定义,如果参考文献(J. Am. Chem. Soc. 1987, 109,7968-7979)的定义,则可以选为电子云密度等值面的值为0.001的曲面。
  
-然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算,均可给出该性质。操作方法:SCM LOGO → View → Add → Isosurface:colored:+然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算,均可给出该性质。本文是关于ADF模块针对分子的计算,单点计算参数设置,参考:[[adf:parameters2020]]中“Main”小节。 
 + 
 +======结果查看===== 
 +操作方法:SCM LOGO → View → Add → Isosurface:colored:
  
 {{ :adf:vandervaasrssurface01.png?500 |}} {{ :adf:vandervaasrssurface01.png?500 |}}
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 注意: 注意:
   - Density SCF,指电子云密度,0.001即该曲面为电子云密度值为0.001 a.u.的曲面   - Density SCF,指电子云密度,0.001即该曲面为电子云密度值为0.001 a.u.的曲面
-  - Culoumb potential SCF即静电势,后面两个方框内的值为的范围,为程序自动计算得出,为了显示更对称,用户可以将数值改为±对称,这样白色的位置即静电势为0+  - Culoumb potential SCF即静电势,后面两个方框内的值为该曲面上静电势的范围,为程序自动计算得出
   - 可以点击左下角第一个选项,选择Show details,设置Opacity的值为40~50左右,该数值为透明度,0表示完全透明,100表示完全不透明   - 可以点击左下角第一个选项,选择Show details,设置Opacity的值为40~50左右,该数值为透明度,0表示完全透明,100表示完全不透明
   - 勾选最右侧的Bar,则显示色条   - 勾选最右侧的Bar,则显示色条
adf/vandervaarssurfacepotential.1597212969.txt.gz · 最后更改: 2020/08/12 14:16 由 liu.jun

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