adf:submitfragment_lsf

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--- adf:submitfragment_lsf [2020/11/23 18:45] – [ADF模块] liu.jun
+++ adf:submitfragment_lsf [2022/07/28 12:30] (当前版本) – [ADF模块] liu.jun
@@ 行 6: / 行 6: @@
   - N个片段计算完成，得到*.results/adf.rkf文件（也就是旧版中的*.t21文件），之后再提交整个体系计算的run文件，但需要事先对该文件进行修改：
-如果正确地设置了片段，那么超分子计算的run文件，应该有类似如下的部分：
+在Windows中如果正确地设置了片段，那么整个体系计算的run文件，应该有类似如下的部分：
   fragments
   CO  CO.rkf
@@ 行 12: / 行 12: @@
   end
-其中CO、Ni就是片段的名字，**但是请注意**：
-<color blue>如果你没有对片段进行命名，那么片段的名字通常就叫Region_1、Region_2……，这个名字与Atoms的部分是一致的，例如：</color>
+在Linux系统中提交作业，软件不能自动改名字，因此用户需要手动修改脚本，指向片段的*.results/adf.rkf文件（Linux上提交作业，默认生成的是ams.results文件夹，建议用户把文件夹名字改掉），例如：
-<code>
-Engine ADF
-    Basis
-        Type TZ2P
-        Core Small
-    End
-    Fragments
-        Region_1 Region_1.rkf
-        Region_2 Region_2.rkf
-    End
-    XC
-        GGA PBE
-        DISPERSION GRIMME4
-    End
-    Relativity
-        Level None
-    End
-EndEngine
-</code>
-如果有N个片段，fragments与end之间就会有N行。
-后面的*.rkf，就是前面计算完毕之后得到的对应的片段的.results/adf.rkf文件。但在Linux中提交的时候，事实上需要将.results/adf.rkf的路径也指明，否则程序并不知道你事先的片段计算得到的adf.rkf在什么地方。
-比如CO.t21在/home/fermitech/example/CO/CO.results/adf.rkf，Ni.t21在/home/fermitech/example/Ni/Ni.results/adf.rkf，那么上面的部分就要做如下修改：
   fragments
@@ 行 50: / 行 23: @@
 =====BAND模块=====
-与ADF模块类似，不过BAND对应的文件名不是*.t21而是*.results文件夹内的band.rkf文件。用户可以在Windows生成的run文件中，直接添加*。results/band.rkf的完整路径即可。例如：
+与ADF模块类似，不过BAND对应的文件是*.results文件夹内的band.rkf文件。用户可以在Windows生成的run文件中，直接添加*.results/band.rkf的完整路径即可。例如：
 <code>
     Fragment

adf/submitfragment_lsf.1606128359.txt.gz · 最后更改: 2020/11/23 18:45 由 liu.jun

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