该功能基于Region，即用户可以为需要设定电荷的区域设置Region，然后通过GUI指定该Region的电荷量。这里我们以50个水分子、50个H⁺、50个OH^-的体系为例。

我们首先创建3种分子的混合物（目前这三种组分都是电中性的，电荷只有设置之后才有效）：

将H原子设置为一个Region，例如名为H，如果我们想将50个H设置为一个Region，则图下图所示，点击该Region右侧的下三角按钮，选择Add Region in Same Way to Identical Molecules:

则所有50个H原子都被添加到该Region中，如下图所示

类似为50个OH分子创建Region： 有时候因为体积的关系，添加进来的OH数目未必是我们预先设定的数目，我们可以检查一下现在有多少个OH：点击该Region后面的√按钮，则该Region所有原子被选中，在左边窗口右下角可以看到，确实是50个OH。

然后，我们可以为H、OH两个Region设置电荷：

上面的电荷设置，在实际的模拟中，未必很合适，仅仅用于演示如何为某些分子、分子群设置电荷。如果在实际中OH^-参与反应，电荷会发生变化，则这样的设置未必合适，建议用户自行测试。

另外，用户可能需要单独为每个离子设定电荷，而不是像本例这样将所有阴阳离子设定总电荷。