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adf:remdofams

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adf:remdofams [2020/03/24 17:21] liu.junadf:remdofams [2020/03/31 18:19] (当前版本) liu.jun
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 ======新的分子动力学反应加速算法REMD====== ======新的分子动力学反应加速算法REMD======
-用法:AMS常规的分子动力学模拟任务生成的*.run文件中,在MolecularDynamics字段内部加入ReplicaExchange字段,例如:+用法:AMS的ADF via AMS、BAND、DFTB、MOPAC常规的分子动力学模拟任务生成的*.run文件中,在MolecularDynamics字段内部加入ReplicaExchange字段,例如:
 <code> <code>
 MolecularDynamics MolecularDynamics
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   * **AllowWrongResults:**REMD算法中,存在多个副本运算,当副本合并产生物理上某些不正确的结果时,允许与其他性质合并。若无此条关键词,则该值取默认值Faulse   * **AllowWrongResults:**REMD算法中,存在多个副本运算,当副本合并产生物理上某些不正确的结果时,允许与其他性质合并。若无此条关键词,则该值取默认值Faulse
   * **EWMALength:**Length of the exponentially weighted moving average used to smooth swap probabilities for monitoring. This value is equal to the inverse of the EWMA mixing factor.默认值为10   * **EWMALength:**Length of the exponentially weighted moving average used to smooth swap probabilities for monitoring. This value is equal to the inverse of the EWMA mixing factor.默认值为10
-  * **SwapFrequency**:Attempt an exchange every N steps.默认值100+  * **SwapFrequency**:交换数据的频率,默认值100步交换一次
   * **TemperatureFactors:**这是两个连续副本的温度比值。第一值设置第二副本相对于第一副本的温度,第二值设置第三副本相对于第二副本的温度,以此类推。如果值个数比nReplicas小,则将最后一个值用于后面所有副本之间温度比。该设置与Temperatures,二者只能使用其中一个。   * **TemperatureFactors:**这是两个连续副本的温度比值。第一值设置第二副本相对于第一副本的温度,第二值设置第三副本相对于第二副本的温度,以此类推。如果值个数比nReplicas小,则将最后一个值用于后面所有副本之间温度比。该设置与Temperatures,二者只能使用其中一个。
   * **Temperatures:**列出除了第一副本外,其他副本的温度。该设置与TemperatureFactors 二者只能使用其中一个。   * **Temperatures:**列出除了第一副本外,其他副本的温度。该设置与TemperatureFactors 二者只能使用其中一个。
adf/remdofams.1585041710.txt.gz · 最后更改: 2020/03/24 17:21 由 liu.jun

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