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adf:remdofams

这是本文档旧的修订版!


新的分子动力学反应加速算法REMD

用法:在MolecularDynamics字段内部加入ReplicaExchange字段,例如:

MolecularDynamics
...
...
  ReplicaExchange
      AllowWrongResults False
      EWMALength 10
      SwapFrequency 100
      TemperatureFactors R1 R2 R3 ...
      Temperatures T2 T3 T4 ...
      nReplicas 4
  END
...
...
END

其中,

  • AllowWrongResults:REMD算法中,存在多个副本运算,当副本合并产生物理上某些不正确的结果时,允许与其他性质合并
  • EWMALength:Length of the exponentially weighted moving average used to smooth swap probabilities for monitoring. This value is equal to the inverse of the EWMA mixing factor.
  • SwapFrequency:Attempt an exchange every N steps
  • TemperatureFactors:这是两个连续副本的温度比值。第一值设置第二副本相对于第一副本的温度,第二值设置第三副本相对于第二副本的温度,以此类推。如果值个数比nReplicas小,则将最后一个值用于后面所有副本之间温度比。该设置与Temperatures,二者只能使用其中一个。
  • Temperatures:列出除了第一副本外,其他副本的温度。该设置与TemperatureFactors 二者只能使用其中一个。
  • nReplicas:副本个数

该方法适用于除ReaxFF外,所有分子动力学,包括BAND、DFTB、MOPAC、ReaxAMS模块

adf/remdofams.1576222874.txt.gz · 最后更改: 2019/12/13 15:41 由 liu.jun

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