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adf:propylacetoneinwater

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adf:propylacetoneinwater [2020/10/13 21:11] – [参数设置] liu.junadf:propylacetoneinwater [2020/12/02 14:56] (当前版本) – 移除 liu.jun
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-====== 精确溶剂化方法FDE计算溶质的紫外光谱计算====== 
  
- 
-=====FDE方法精确考虑溶剂的影响===== 
-理论参考:[[adf:fdemethod]]。 
-本例分子结构: 
- 
-<code> 
-C      -1.23174200      -0.67677500      -1.86976600 
-C      -0.52638000      -0.28484800      -0.60107500 
-C      -1.19636100       0.78511900       0.21337600 
-C       0.64033800      -0.89620600      -0.26380600 
-C       1.46404800      -0.61893500       0.91182700 
-C       2.68861000      -1.49214000       1.10358100 
-O       1.23357700       0.31454500       1.70629100 
-H      -0.67065000      -1.41408500      -2.45588000 
-H      -1.40622600       0.21699500      -2.48972200 
-H      -2.22525300      -1.08963500      -1.63255000 
-H      -1.14058200       0.56857600       1.28644500 
-H      -2.24403100       0.90562100      -0.09039000 
-H      -0.68940600       1.75352700       0.06956500 
-H       1.01874600      -1.67422400      -0.92892200 
-H       3.08197900      -1.37624400       2.11860900 
-H       3.46736600      -1.17214000       0.39209200 
-H       2.46961500      -2.54811200       0.89655100 
-O       0.78106400       3.33865100       1.49688500 
-H       0.58759100       2.40752000       1.73488500 
-H       1.65755900       3.25142800       1.03909500 
-O       3.35124800       1.54283800       3.04430000 
-H       2.56336200       1.00595600       2.75883600 
-H       2.94637400       2.34540200       3.44353900 
-O       3.27784300       2.39931600       0.33968000 
-H       3.50799200       2.13180000       1.27275900 
-H       2.71636800       1.65760600       0.03185200 
-</code> 
-====参数设置==== 
-将体系分为两个区域(溶剂、溶质两个区域),分区的操作如果不熟悉,可以参考[[adf:creatregion]] 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation04.png?600 |}} 
- 
-设置基本的激发态计算参数: 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation05.png?600 |}} 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation07.png?600 |}} 
-单独为H指定较小的基组DZP(不冻芯) 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation09.png?600 |}} 
- 
-FDE方法必须使用STO拟合电子密度: 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation06.png?600 |}} 
- 
-FDE方法必须设置Nosym: 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation10.png?600 |}} 
- 
-点击下图中+,设置water分区为FDE分区,并勾选Relax表示考虑溶剂、溶质的互相影响: 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation08.png?600 |}} 
- 
-勾选Relax,将会反复计算两个分区,直到达到平衡,如果不勾选,计算量则小很多。 
- 
-**<color blue>Multilevel - Use fragment 勾选</color>** 
- 
-保存并提交任务,参考:[[adf:maintance]] 
- 
-====结果查看==== 
-点击ADF LOGO > Spectra,显示溶质的紫外吸收光谱。默认横坐标是Hartree,Axes - Horizontal Unit可以修改为nm: 
- 
-{{ :adf:fdeforsolvation11.png?600 |}} 
- 
-两个吸收峰如图中绿色框所示,其中波长最长的吸收峰非常低。点击下方绿框内具体的吸收峰,右下方将用蓝色数字显示其构造(由哪个占据轨道跃迁到哪个空轨道,点击蓝字,可以分别将两个轨道的形状显示出来),并可以调整显示的效果(参考:[[adf:others]]) 
- 
-  * 计算有机物的紫外可见吸收谱,往往使用B3LYP能得到很好的结果,但该泛函不适用于多金属中心体系 
-  * 选择菜单栏Axes - Molar Adsorption Coefficient,将显示摩尔吸收系数 
-  * 横坐标单位为Hartree,点击菜单栏Axes - Horizontal Unit - nm可以修改为nm,但是注意横坐标不要出现负值,否则转换的时候会报错 
-  * 吸收峰的强度只要不为0,往往在实验中就能观察到 
adf/propylacetoneinwater.1602594671.txt.gz · 最后更改: 2020/10/13 21:11 由 liu.jun

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