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adf:propylacetoneinwater

精确溶剂化方法FDE计算溶质的紫外光谱计算

FDE方法精确考虑溶剂的影响

理论参考:FDE方法。 本例分子结构:

C      -1.23174200      -0.67677500      -1.86976600
C      -0.52638000      -0.28484800      -0.60107500
C      -1.19636100       0.78511900       0.21337600
C       0.64033800      -0.89620600      -0.26380600
C       1.46404800      -0.61893500       0.91182700
C       2.68861000      -1.49214000       1.10358100
O       1.23357700       0.31454500       1.70629100
H      -0.67065000      -1.41408500      -2.45588000
H      -1.40622600       0.21699500      -2.48972200
H      -2.22525300      -1.08963500      -1.63255000
H      -1.14058200       0.56857600       1.28644500
H      -2.24403100       0.90562100      -0.09039000
H      -0.68940600       1.75352700       0.06956500
H       1.01874600      -1.67422400      -0.92892200
H       3.08197900      -1.37624400       2.11860900
H       3.46736600      -1.17214000       0.39209200
H       2.46961500      -2.54811200       0.89655100
O       0.78106400       3.33865100       1.49688500
H       0.58759100       2.40752000       1.73488500
H       1.65755900       3.25142800       1.03909500
O       3.35124800       1.54283800       3.04430000
H       2.56336200       1.00595600       2.75883600
H       2.94637400       2.34540200       3.44353900
O       3.27784300       2.39931600       0.33968000
H       3.50799200       2.13180000       1.27275900
H       2.71636800       1.65760600       0.03185200

参数设置

将体系分为两个区域(溶剂、溶质两个区域),分区的操作如果不熟悉,可以参考如何创建分区

设置基本的激发态计算参数:

单独为H指定较小的基组DZP(不冻芯)

FDE方法必须使用STO拟合电子密度:

FDE方法必须设置Nosym:

点击下图中+,设置water分区为FDE分区,并勾选Relax表示考虑溶剂、溶质的互相影响:

勾选Relax,将会反复计算两个分区,直到达到平衡,如果不勾选,计算量则小很多。

Multilevel - Use fragment 勾选

保存并提交任务,参考:提交作业方式、设定作业核数、软件安装与升级[目录]

结果查看

点击ADF LOGO > Spectra,显示溶质的紫外吸收光谱。默认横坐标是Hartree,Axes - Horizontal Unit可以修改为nm:

两个吸收峰如图中绿色框所示,其中波长最长的吸收峰非常低。点击下方绿框内具体的吸收峰,右下方将用蓝色数字显示其构造(由哪个占据轨道跃迁到哪个空轨道,点击蓝字,可以分别将两个轨道的形状显示出来),并可以调整显示的效果(参考:GUI(图形界面)常见问题及解决方式[目录]

  • 计算有机物的紫外可见吸收谱,往往使用B3LYP能得到很好的结果,但该泛函不适用于多金属中心体系
  • 选择菜单栏Axes - Molar Adsorption Coefficient,将显示摩尔吸收系数
  • 横坐标单位为Hartree,点击菜单栏Axes - Horizontal Unit - nm可以修改为nm,但是注意横坐标不要出现负值,否则转换的时候会报错
  • 吸收峰的强度只要不为0,往往在实验中就能观察到
adf/propylacetoneinwater.txt · 最后更改: 2020/10/13 21:11 由 liu.jun

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