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adf:peda-nocv-polymer

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adf:peda-nocv-polymer [2019/12/09 20:16] – [第二步:设置参数] liu.junadf:peda-nocv-polymer [2022/06/28 15:31] (当前版本) liu.jun
行 1: 行 1:
-======ETS-NOCV计算:聚合物的片段相互作用电子转移======+======ETS-NOCV计算:聚合物吸附成键的化学键分析======
 =====预备知识===== =====预备知识=====
 **由于pEDA分析支持正常k空间布点,而NOCV则只支持Gamma点,因此建议二者分别计算。本文使用AMS2019.301完成。** **由于pEDA分析支持正常k空间布点,而NOCV则只支持Gamma点,因此建议二者分别计算。本文使用AMS2019.301完成。**
  
-NOCV orbital、NOCV density、NOCV Def(ference) density的化学直观含义,参考:[[adf:theoryofets-nocv]],尤其是[[adf:nocv-disdinguishbonding|ETS-NOCV方法将EDA(能量分解)中Orbital Interactions具体分解到不同轨道上]]+NOCV orbital、NOCV density、NOCV Def(ference) density的化学直观含义,参考:[[adf:theoryofets-nocv]],尤其是[[adf:nocv-disdinguishbonding2020|ETS-NOCV方法将EDA(能量分解)中Orbital Interactions具体分解到不同轨道上]]
  
 =====模型===== =====模型=====
行 100: 行 100:
                      E_tot=    -25.9 kJ/mol                      E_tot=    -25.9 kJ/mol
 </code> </code>
-可以看到贡献主要是第一组本征值为±0.1419的NOCV贡献出来(注意,本征值必须严格±成对,否则NOCV数据不可用),我们需要记住这个本征值,然后来查看该NOCV的具体情况。+可以看到贡献主要是第一组本征值为±0.1419的NOCV贡献出来(注意,本征值必须严格±成对,否则NOCV数据不可用。有时候没有在Multilevel中,为片段指定正确的Spin Polarization,也会导致本征值不配对),我们需要记住这个本征值,然后来查看该NOCV的具体情况。
 SCM → View → Add → Isosurface: With Phase → Select Field → NOCV Orbitals。 SCM → View → Add → Isosurface: With Phase → Select Field → NOCV Orbitals。
  
行 127: 行 127:
 参考:[[adf:picture]] 参考:[[adf:picture]]
  
-延伸阅读:[[adf:theoryofets-nocv]]、[[adf:nocv-disdinguishbonding]]+延伸阅读:[[adf:theoryofets-nocv]]、[[adf:nocv-disdinguishbonding2020]]
  
-=====电子的转移===== 
  
-NOCV是成对出现的(alpha、beta),一般研究第i个NOCV带来的电子转移,要把第i个alpha的NOCV的NOCV Def Densities和第i个beta的NOCV的NOCV Def Densities加起来:SCM LOGO > View, Fields > Grid > Fine, Fields > calculate,之后窗口下方 
- 
- 
-{{:adf:nocvnnn.png|}} 
- 
- 
-  - 第一个是编号,此处为C-1,后面会用到 
-  - 第二个是选择要加的第1个量,选择例如NOCV Def Densities列表中第1个 
-  - 第三个是选择符号,默认为-,这里改为+ 
-  - 第四个是要加的第二个量,选择例如NOCV Def Densities列表中第2个(通常第2n个和第2n+1个(n>=0)是同一个NOCV的两种自旋) 
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-之后,Add>Isosurface: With Phase,然后在下方Select Field区域选择Other,然后选中列表中的C-1。如此则显示了第1个NOCV的alpha和beta轨道,带来的电子的转移。 
- 
-根据“NOCV对”(包含alpha和beta)对ΔE<sub>orb</sub>的贡献大小(例如前面看到,第一个NOCV对ΔE<sub>orb</sub>的贡献是-388.32211kcal/mol),找到形成该键,主要的是第几个“NOCV对”(包含alpha和beta)的贡献?从而根据该“NOCV对”的Def Densities加和,来判断出形成该键的时候,电子是从什么轨道转移到什么轨道?根据该“NOCV对”的Def Densities加和是sigma型还是Pi型、芳香型,来判断是不是从sigma轨道转移到Pi轨道?等等。 
- 
-如果将所有“NOCV对”的Def Densities加和,则得到形成该键的总的电荷转移。但一般而言,实际上主要贡献的“NOCV对”只有1~2对。因此一般看前1对,2对的Def Densities加和就能看出规律来了。 
adf/peda-nocv-polymer.1575893778.txt.gz · 最后更改: 2019/12/09 20:16 由 liu.jun

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