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adf:pbsorlsf

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adf:pbsorlsf [2022/11/13 11:28] – [注意:] liu.junadf:pbsorlsf [2023/07/21 12:36] (当前版本) – [2,如果集群可以使用GUI] liu.jun
行 2: 行 2:
 =====注意:===== =====注意:=====
  
-  * **每个集群脚本完全不同,以下范例仅供参考,请勿照抄。**+  * **每个集群脚本完全不同,以下范例仅供参考,请勿照抄。应该首先拿到自己集群的脚本,在该脚本基础上,参考下文进行修改,而非反过来。**
 =====一、LSF系统===== =====一、LSF系统=====
 ====1,脚本样本==== ====1,脚本样本====
行 34: 行 34:
 cd .. cd ..
 rm -rf ${JOBNAME} rm -rf ${JOBNAME}
-rm ${PBS_JOBNAME}.o* ${PBS_JOBNAME}.e* 
 </code> </code>
 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内,并在上述脚本文件中 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内,并在上述脚本文件中
行 80: 行 79:
 cd .. cd ..
 rm -rf ${JOBNAME} rm -rf ${JOBNAME}
-rm ${PBS_JOBNAME}.o* ${PBS_JOBNAME}.e* 
 </code> </code>
 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内,并在上述脚本文件中<code bash>JOBNAME=</code>填写上具体的名字即可提交,例如上传的文件是123.run,则JOBNAME=123。 用户将该脚本和run文件与脚本文件放到同一个文件夹内,并在上述脚本文件中<code bash>JOBNAME=</code>填写上具体的名字即可提交,例如上传的文件是123.run,则JOBNAME=123。
行 92: 行 90:
 说明如下: 说明如下:
   - Queue Name:可以根据用户习惯设置,用于提醒用户这个队列的特征,不能包含中文、空格   - Queue Name:可以根据用户习惯设置,用于提醒用户这个队列的特征,不能包含中文、空格
-  - Remote host:必须填写localhost,即在本节点提交作业(到集群其他计算节点)+  - Remote host:必须填写localhost,即在本节点提交作业(到集群其他计算节点),当然也可以写登录节点的IP或者其他机器名
   - Remote job directory:作业存放路径,这个可以较为灵活设置,一般不影响使用,因为实际使用过程中,仍然可以选择存储在任何其他路径中   - Remote job directory:作业存放路径,这个可以较为灵活设置,一般不影响使用,因为实际使用过程中,仍然可以选择存储在任何其他路径中
   - Run command:原则上这里汇集了PBS脚本的前几行的信息,照抄即可,最后是“ $job”结尾   - Run command:原则上这里汇集了PBS脚本的前几行的信息,照抄即可,最后是“ $job”结尾
   - Prolog command:用source语句读取软件中的amsbashrc.sh文件,使得环境变量生效   - Prolog command:用source语句读取软件中的amsbashrc.sh文件,使得环境变量生效
 +
 +
 =====三、SLURM系统===== =====三、SLURM系统=====
 参考:[[adf:slurm]] 参考:[[adf:slurm]]
  
 **如果运行有问题,可以咨询ams@fermitech.com.cn。** **如果运行有问题,可以咨询ams@fermitech.com.cn。**
adf/pbsorlsf.1668310127.txt.gz · 最后更改: 2022/11/13 11:28 由 liu.jun

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