差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

--- adf:nics [2020/11/18 21:46] – [保存该文件后，运行该文件] liu.jun
+++ adf:nics [2020/11/19 10:30] (当前版本) – 移除 liu.jun
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-====== 如何计算Nucleus Independent Chemical Shifts======
-=====参数设置 =====
-将[[adf:geoopt2019|优化]]好的结构导入ADFinput，并依次设置参数如下图所示：
-{{ adf:nics01.jpg?650 }}
-在希望计算NICS的位置上，添加Ghost原子，也即元素周期表中右下角的Xx原子
-{{ adf:nics02.jpg?650 }}
-在Properties—NMR菜单中将Ghost原子Xx选中，点击下图所示的“+”：
-{{ adf:nics04.jpg?650 }}
-取消对称性：
-{{ adf:nics03.jpg?650 }}
-=====保存该文件后，运行该文件=====
-参考：[[adf:maintance]]
-，结果查看：
-在生成的logfile文件末尾我们可以看到我们需要计算的这个点的化学位移量(即Gh(1))：
-<code>
-<Dec06-2019> <23:40:07>  NMR Shielding ADF-GUI atom   P(1):         162.70 ppm
-<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGP
-<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGD
-<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(2):         175.97 ppm
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD
-<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(3):         175.99 ppm
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD
-<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(4):         175.97 ppm
-<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGP
-<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGD
-<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding  Gh(1):           0.84 ppm
-</code>
-注意屏蔽量是一个相对量。某个原子的NMR屏蔽量，需要一个标准原子的屏蔽量与实验值进行对准后，得到该点的屏蔽量：
-$δ_i =σ_{example} + δ_{example} - σ_i$
-其中
-  * $δ_i$是平移后的值，可以与实验值直接比较
-  * $σ_{example}$是样本实验值
-  * $δ_{example}$是样本计算值
-  * $σ_i$是平移前的计算值
-在out文件的末尾也可以看到类似更详细的内容，包括顺磁、逆磁、总和：
-<code>
-****  G H O S T : Gh(1)
-                 COORDINATES (ANGSTROMS)
-                 -------------------------------------
-.5271     -0.3214     -0.0960
- Internal NMR numbering of atoms: Gh(5)
-===  PARAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm)
-                     paramagnetic b^(1) =      0.000
-                     paramagnetic u^(1) =    -29.814
-                     paramagnetic s^(1) =     20.010
-                     paramagnetic gauge =      8.049
-          ------------------------------------------
-                     total paramagnetic =     -1.756
-          ------------------------------------------
-===  DIAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm)
-                       diamagnetic core =      0.000
-                    diamagnetic valence =      2.596
-          ------------------------------------------
-                      total diamagnetic =      2.596
-          ------------------------------------------
-===  TOTAL ISOTROPIC NMR SHIELDING (ppm)
-          ------------------------------------------
-              total isotropic shielding =      0.840
-          ------------------------------------------
-</code>
-=====NICS=====
-Ghost可以被看作是一个中子，因此该点的NICS的值为该点的屏蔽张量中的各向同性值(也就是logfile中该点的NMR Shielding值)乘以-1。
-AMS提供**免费试用**（一般为一个月），试用申请方式参考：[[adf:trial|]]**

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