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adf:nics

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adf:nics [2019/12/06 23:53] – [保存该文件后,运行该文件] liu.junadf:nics [2020/11/19 10:30] (当前版本) – 移除 liu.jun
行 1: 行 1:
-====== 如何计算Nucleus Independent Chemical Shifts====== 
-1,将[[adf:geoopt|优化]]好的结构导入ADFinput,并依次设置参数如下图所示: 
  
-{{ adf:nics01.jpg?650 }} 
- 
-在希望计算NICS的位置上,添加Ghost原子,也即元素周期表中右下角的Xx原子 
- 
-{{ adf:nics02.jpg?650 }} 
- 
-在Properties—NMR菜单中将Ghost原子Xx选中,点击下图所示的“+”: 
- 
-{{ adf:nics04.jpg?650 }} 
- 
-取消对称性: 
- 
-{{ adf:nics03.jpg?650 }} 
- 
-=====保存该文件后,运行该文件===== 
-参考:[[adf:maintance]] 
- 
-3,结果查看: 
- 
-在生成的logfile文件末尾我们可以看到我们需要计算的这个点的化学位移屏蔽量(即Gh(1)): 
- 
-<code> 
-<Dec06-2019> <23:40:07>  NMR Shielding ADF-GUI atom   P(1):         162.70 ppm 
-<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGP 
-<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGD 
-<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(2):         175.97 ppm 
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP 
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD 
-<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(3):         175.99 ppm 
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP 
-<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD 
-<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(4):         175.97 ppm 
-<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGP 
-<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGD 
-<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding  Gh(1):           0.84 ppm 
-</code> 
- 
-注意屏蔽量是一个相对量。需要其他原子的屏蔽量与实验值进行对准后,同等平移矫正,得到该点的屏蔽量。 
- 
-在out文件的末尾也可以看到类似更详细的内容,包括顺磁、逆磁、总和: 
-<code> 
-****  G H O S T : Gh(1) 
-  
-                 COORDINATES (ANGSTROMS)  
-                 ------------------------------------- 
-                       1.5271     -0.3214     -0.0960 
- Internal NMR numbering of atoms: Gh(5) 
-  
-  
-===  PARAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm) 
-  
-                     paramagnetic b^(1) =      0.000 
-                     paramagnetic u^(1) =    -29.814 
-                     paramagnetic s^(1) =     20.010 
-                     paramagnetic gauge =      8.049 
-          ------------------------------------------ 
-                     total paramagnetic =     -1.756 
-          ------------------------------------------ 
-  
-  
-===  DIAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm) 
-  
-                       diamagnetic core =      0.000 
-                    diamagnetic valence =      2.596 
-          ------------------------------------------ 
-                      total diamagnetic =      2.596 
-          ------------------------------------------ 
-  
-  
-===  TOTAL ISOTROPIC NMR SHIELDING (ppm) 
-  
-          ------------------------------------------ 
-              total isotropic shielding =      0.840 
-          ------------------------------------------ 
-</code> 
- 
-=====NICS===== 
-Ghost可以被看作是一个中子,因此该点的NICS的值为该点的屏蔽张量中的各向同性部分乘以-1——也就是logfile中,该点的NMR Shielding值乘以-1。 
- 
-终。 
- 
-AMS提供**免费试用**(一般为一个月),试用申请方式参考:[[adf:trial|]]** 
adf/nics.1575647590.txt.gz · 最后更改: 2019/12/06 23:53 由 liu.jun

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