差别

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--- adf:nexafs_xanes [2020/12/02 16:44] – [优化$CH_2O$基态结构] liu.jun
+++ adf:nexafs_xanes [2020/12/02 16:44] (当前版本) – 移除 liu.jun
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-======X射线近边吸收光谱（XANES）、扩展X射线吸收精细结构谱（EXAFS）======
-=====Transition Potential方法（用于计算K边吸收）=====
-以$CH_2O$为例：
-====优化$CH_2O$基态结构====
-参考：[[adf:geoopt2020]]
-优化结束后，可以在level中查看感兴趣的内层电子，例如A1不可约表示中的最低能级，也就是1 A1，实际上就是O原子的1s轨道。
-====计算XANES的参数设置====
-使用前面优化得到的结构。注意Main菜单（基态相关的设置）中，勾选了Unrestricted：
-{{ :adf:naxes-tp01.png?650 }}
-保存并运行。这时候生成了*.t21文件，便于后面设置占据数。Model - Spin and Occupations这里读取了生成的*.t21文件，从而显示电子的占据情况，将要激发的电子，占据数从1修改为0.5：
-{{ :adf:naxes-tp02.png?650 }}
-ADFinput > Properties > Excitations(UV/VIS),CD设置如下：
-{{ :adf:naxes-tp03.png?650 }}
-点击Select Excitations后面的…详细设置激发态：
-{{ :adf:naxes-tp04.png?650 }}
-如上图设置，只计算-20~-19.5Hartree之间的占据电子（从后面的计算结果来看，这个范围的，实际上就是O原子1s电子中，占据0.5beta电子的轨道能级。用户可以先如上所示一样，去掉激发态的设置，计算一遍基态，得到占据0.5电子的那个能级的范围，之后将激发的范围设定在这个区域）
-提交任务。
-====结果查看====
-ADF LOGO > Spectra可以看到
-{{ :adf:naxes-tp05.png?650 }}
-最低的激发能是532.6eV，与[[http://www.anorg.chem.uu.nl/people/staff/FrankdeGroot/woXS/petterson/Material/Triguero DFT XAS PRB58.pdf|文献（点击打开）]]中，Tabe I中“Oxygen in carbonyls”$H_2CO$一致。
-<color green>使用鼠标滚轮可以放大缩小图谱，也可以左右拖动。调整横坐标到正确的区域之后，可以更好地显示的吸收谱。</color>
-=====SOC-TDDFT方法（用于计算L边吸收）=====
-以$TiCl_4$为例
-====优化$TiCl_4$基态结构====
-基本设置，参考：[[adf:geoopt]]，注意本例Relativity设置为Scalar，xc Functional设置为GGA-D>BP-D3(BJ)，Core type：none
-优化结束后，可以在level中查看感兴趣的内层电子，例如2 T2能级，实际上就是Ti的2P轨道（注意如下图中level图所示，其组分是1P:x、1P:y、1P:z，其数字1表示第1个P轨道，对没有冻芯的计算来说，Ti的第1个P轨道，实际上就是2P轨道）
-{{ :adf:naxes-tp06.png?350 }}
-====计算XANES的参数设置====
-{{ :adf:naxes-tp07.png?650 }}
-{{ :adf:naxes-tp08.png?650 }}
-{{ :adf:naxes-tp09.png?650 }}
-类似地，ADF LOGO > Spectra可以看到吸收谱。默认会显示考虑SOC以及不考虑SOC两种情况的吸收谱，View - Show Curve，只保留*.t21 with perturbation（也就是考虑SOC的结果）的勾选：
-{{ :adf:naxes-tp10.png?650 }}
-<color green>使用鼠标滚轮可以放大缩小图谱，也可以左右拖动。调整横坐标到正确的区域之后，可以更好地显示的吸收谱。</color>
-=====参考材料=====
-  * [[https://www.scm.com/wp-content/uploads/Videos/Optical_Xray_Absorption_Spectra_ADF.mp4|视频讲解理论（英文）]]
-  * {{ :adf:optical_xray_absorption_spectra_adf.pdf |视频使用的PPT}}
-  * {{ :adf:nexafs_workflow.pptx |ADF软件计算设置介绍}}<color green>（注意：1，请将文件下载后阅读，在线阅读有误差；2，内层电子去掉0.5的时候，2016版及其以前的版本可能需要同时设置Charge为0.5，否则会报错，教程中没有提到这一点，2017版则不需要）</color>
-=====文献=====
-  * G. Fronzoni, R. De Francesco, and M. Stener, L2,3 edge photoabsorption spectra of bulk V2O5: a two components relativistic time dependent density functional theory description with finite cluster model J. Chem. Phys., 137 2240308 (2012)
-  * G. Barcaro, L. Sementa, A. Fortunelli, and M. Stener, Optical Properties of Silver Nanoshells from Time-Dependent Density Functional Theory Calculations, J. Phys. Chem. C, 118, 12450-12458 (2014)
-  * G. Fronzoni, G. Balducci, R. De Francesco, M. Romeo, and M. Stener, Density Functional Theory Simulation of NEXAFS Spectra of Molecules Adsorbed on Surfaces: C2H4 on Si(100) Case Study J. Phys. Chem. C, 116 18910-18919 (2012).

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