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adf:nexafs_xanes [2018/03/14 13:31] – [结果查看] liu.jun | adf:nexafs_xanes [2020/12/02 16:44] (当前版本) – 移除 liu.jun | ||
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行 1: | 行 1: | ||
- | ======X射线近边吸收光谱(XANES)、扩展X射线吸收精细结构谱(EXAFS)====== | ||
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- | =====Transition Potential方法(用于计算K边吸收)===== | ||
- | 以$CH_2O$为例: | ||
- | ====优化$CH_2O$基态结构==== | ||
- | 参考:[[adf: | ||
- | |||
- | 优化结束后,可以在level中查看感兴趣的内层电子,例如A1不可约表示中的最低能级,也就是1 A1,实际上就是O原子的1s轨道。 | ||
- | ====计算XANES的参数设置==== | ||
- | 使用前面优化得到的结构。注意Main菜单(基态相关的设置)中,勾选了Unrestricted: | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | ADFinput > Model > Spin and Occupation > Run ADF Guess,之后修改1 A1的电子占据数,beta电子从1.0改为0.5 | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | ADFinput > Properties > Excitations(UV/ | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 点击Select Excitations后面的…详细设置激发态: | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 如上图设置,只计算-20~-19.5Hartree之间的占据电子(从后面的计算结果来看,这个范围的,实际上就是O原子1s电子中,占据0.5beta电子的轨道能级。用户可以先如上所示一样,去掉激发态的设置,计算一遍基态,得到占据0.5电子的那个能级的范围,之后将激发的范围设定在这个区域) | ||
- | |||
- | ====保存任务,并检查*.run文件==== | ||
- | 提交任务前,务必检查*.run文件。2017版中,*.run文件内容如下: | ||
- | <code bash> | ||
- | #! /bin/sh | ||
- | |||
- | " | ||
- | ATOMS | ||
- | 1 C | ||
- | 2 O | ||
- | 3 H | ||
- | 4 H | ||
- | END | ||
- | |||
- | GUIBONDS | ||
- | 1 1 3 1.0 | ||
- | 2 1 4 1.0 | ||
- | 3 1 2 2.0 | ||
- | END | ||
- | |||
- | |||
- | UNRESTRICTED | ||
- | |||
- | BASIS | ||
- | type TZP | ||
- | core None | ||
- | createoutput None | ||
- | END | ||
- | |||
- | XC | ||
- | GGA PW91 | ||
- | END | ||
- | |||
- | |||
- | EXCITATIONS | ||
- | SingleOrbTrans | ||
- | ALLOWED | ||
- | lowest 100 | ||
- | NTO | ||
- | END | ||
- | |||
- | MODIFYEXCITATION | ||
- | UseOccRange -20 -19.5 | ||
- | END | ||
- | |||
- | OCCUPATIONS | ||
- | A1 5.0 // 0.5 4.0 | ||
- | A2 0.0 // 0.0 | ||
- | B1 1.0 // 1.0 | ||
- | B2 2.0 // 2.0 | ||
- | END | ||
- | |||
- | NOPRINT LOGFILE | ||
- | |||
- | eor | ||
- | </ | ||
- | 注意确保: | ||
- | * 虽然带了0.5电荷,但2017版中,删除了Charge的设置,程序根据电子的占据情况,自动匹配相应的charge,旧版本中可能需要设置charge 0.5; | ||
- | * 占据方式中A1不可约表示有一个beta能级上只占据了0.5个电子; | ||
- | |||
- | 提交任务。 | ||
- | ====结果查看==== | ||
- | ADF LOGO > Spectra可以看到 | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 最低的激发能是532.5eV,与[[http:// | ||
- | |||
- | <color green> | ||
- | =====SOC-TDDFT方法(用于计算L边吸收)===== | ||
- | 以$TiCl_4$为例 | ||
- | ====优化$TiCl_4$基态结构==== | ||
- | 基本设置,参考:[[adf: | ||
- | |||
- | 优化结束后,可以在level中查看感兴趣的内层电子,例如2 T2能级,实际上就是Ti的2P轨道(注意如下图中level图所示,其组分是1P: | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | ====计算XANES的参数设置==== | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | {{ : | ||
- | |||
- | 类似地,ADF LOGO > Spectra可以看到吸收谱。 | ||
- | =====参考材料===== | ||
- | * [[https:// | ||
- | * [[https:// | ||
- | * [[https:// | ||
- | =====文献===== | ||
- | * G. Fronzoni, R. De Francesco, and M. Stener, L2,3 edge photoabsorption spectra of bulk V2O5: a two components relativistic time dependent density functional theory description with finite cluster model J. Chem. Phys., 137 2240308 (2012) | ||
- | * G. Barcaro, L. Sementa, A. Fortunelli, and M. Stener, Optical Properties of Silver Nanoshells from Time-Dependent Density Functional Theory Calculations, | ||
- | * G. Fronzoni, G. Balducci, R. De Francesco, M. Romeo, and M. Stener, Density Functional Theory Simulation of NEXAFS Spectra of Molecules Adsorbed on Surfaces: C2H4 on Si(100) Case Study J. Phys. Chem. C, 116 18910-18919 (2012). |