如果有现成的晶体结构（比如pdb或者cif格式，大多数xyz格式一般没有晶格常数所以不太用于描述晶体），在ADFinput中，切换到ReaxFF模块，File > Import Coordinates导入该文件即可。如下图所示，去掉region（软件默认将其作为一个region，在本例中与region功能没有关系，所以去掉与否都没有影响，但有的功能与region有关系，比如不同分区设置不一样的温度，就有关系，需要去掉这种默认的分区），然后Edit > Crystal > generate Slab：

然后，设置切面的米勒指数和厚度（切多少层？），如下图所示，沿着111面切3层：

切完之后，在ReaxFF中实际上默认就给了一个Cell，只是没有显示出来而已，我们恢复显示：

可以看到是一个xy方向周期性延展，z方向是一层真空，z方向Cell尺寸为40.23437585埃，调整该数值，可以调整真空层的大小。

不过要注意，z方向其实也是周期性延展的（Cell本身是xyz三个方向重复的）。那么一般而言，我们调整了z方向尺寸之后，希望在xy方向扩大二维晶胞，所以需要做超胞，如下图所示，xy方向我们做5*5的超胞，z方向保持不变（设为1）：

超胞做完之后，Edit > Builder，弹出如下窗口：

上图中，第一个红色方框内的数字，设置加入多少个分子，第二个红色框可以输入一些常见分子的名字，这些分子在ADF分子库里面有，比如water。如果不是常见分子，那么用户自己需要创建这个分子的xyz文件（创建分子参考建模：ADF模块分子的基本建模功能演示（视频），导出分子的xyz文件（File > Export Coordinates，之后输入导出文件的名字，比如123.xyz）即可。在此处可以点击第三个红框导入之前准备好的分子坐标文件(*.xyz）。

第四个红框，是用户可以设置分子与分子、固体表面之间的最小间距，默认就是2.5埃。第五个红框是加入分子之后，整个体系的密度。

如果用户不止添加一种分子，那么可以点击上方的➕molecules，增加一个列表，之后同样输入个数、名字（或导入xyz文件）。

之后，点击Generate Molecules即可：

分子如此就均匀分布在真空区域了。本例中，因为要求分子间距不低于2.5埃，所以有一些分子就放不进去，默认放进去的分子就不足100了，系统自动将那些加不进来的分子去掉了。这时候，整个体系就不在Cell的中心。这实际上对计算没有任何影响，但可能为了好看，可以将其移动进去，如下图操作：

完成。

可以可以修改一下显示的方式：修改原子的显示方式（球棍、棍）