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adf:logp

这是本文档旧的修订版!


如何计算分配系数logP

COSMO-RS模块的计算,都需要相应分子的*.coskf文件,ADF自带一个普通分子的*.coskf库(初次打开COSMO-RS会自动下载),以及离子液体*.coskf库(需要手动下载,地址为:http://downloads.scm.com/Downloads/crs/ADFCRS-IL-2014.zip)。下载完毕、解压之后,可以保存电脑中任何(不含中文、空格等非标准英文字符的)路径下面,使用的时候,临时导入所需的分子即可。如果库中没有自己想要计算的分子的话,自己手动制备也非常容易,制备*.coskf的方法非常简单,参考coskf

SCM LOGO > COSMO-RS打开COSMO-RS模块,点击Compounds > Add Compound(s) 添加*.coskf文件。为了更精确的计算,用户可以对窗口列出的所有导入的分子,更精细的描述:选中某个分子,右边会列出该分子的性质,下方Input Data中,用户应尽量正确输入关于分子的正确描述,例如Nring(芳香环原子个数)。设置完毕之后,保存任务。

SCM LOGO > COSMO-RS打开COSMO-RS模块。之后点击Properties → Partition Coefficients (LogP)。计算前,准备coskf文件,参考费米科技WIKI>coskf

弹出的窗口中,点击:Preset Octanol-Water

设置两个相的摩尔比、摩尔体积、温度,之后点击run即保存任务(目录、文件名不要包含中文名和空格,否则会出错)并运行。

之后,右边给出结果:

注意:下图的“User Defined 2 components”可以自定义其他溶剂。

adf/logp.1510456000.txt.gz · 最后更改: 2017/11/12 11:06 由 liu.jun

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