adf:liq-gas

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--- adf:liq-gas [2019/12/10 16:36] – 移除 liu.jun
+++ adf:liq-gas [2021/08/19 13:47] (当前版本) – [前言] liu.jun
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+======创建气液界面======
+=====前言=====
+气体、液体，在ReaxFF中，只是在密度上有所差别。而ReaxFF不能考虑重力，因此实际上气-液混合物最后会变成均匀混合物。这里只是讨论创建模型。这里以水、氧气为例说明。
+需要特别注意：**Cell是具有三维周期边界条件的，所以这种模型实际上是气体-液体-气体-液体……无线循环、无限大的。**
+=====创建液体=====
+AMSinput（模块切换到ReaxFF） - Edit - Builder - 添加水分子，并调整个数、Cell的体积，直到密度符合实际情况，例如：
+{{ :adf:liq-gas01.png?650 }}
+Generate按钮，生成液体体系。然后通过按住Shift键+鼠标画框的方式，选中要去掉的液体（给气体分子留下空间）：
+{{ :adf:liq-gas02.png?650 }}
+鼠标画框选中的分子，有的只是部分原子被选中，因此不能直接删除，否则就留下了残基，因此按Ctrl m键，令整个分子被选中：
+{{ :adf:liq-gas03.png?650 }}
+del键删除这些选中的完整的分子。
+View - Periodic - Show Unit Cell，显示Cell（这不是必须的操作。）
+=====填充气体=====
+Model - Region去掉“Auto_Generated”这个Region（这一步是必须的），然后回到Edit - Builder窗口，添加气体分子：
+{{ :adf:liq-gas04.png?650 }}
+{{ :adf:liq-gas05.png?650 }}
+{{ :adf:liq-gas06.png?650 }}

adf/liq-gas.1575966986.txt.gz · 最后更改: 2019/12/10 16:36 由 liu.jun

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