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adf:hbd-hba

HBA与HBD的σ-profile特征

1,σ-profile 是分子表面屏蔽电荷的密度,而不是分子的电子密度,因此二者符号是相反的,例如水分子中的 O 原子表面电势为负值:

那么 O 附近的屏蔽电荷密度,如下图所示就是正值(注意下图蓝色为负值,与上图是相反的):

此处能成为氢键的受体,因此在 σ-profile 中,氢键受体为强正值部分。类似地,氢键供体为强负值部分,类似如下:

hbd-hba.jpg

而 σ-potential 则描述对不同屏蔽电荷密度 σ 的亲和程度(负的越多,亲和越强)。因此可以对照组分 A 的 σ-profile 与组分 B 的 σ-potential,来评估 A-B 形成氢键的可能性。当然也可以直接看 A、B 的 σ-profile 是否存在强 HBA、HBD 区来评估。当然这种方法是非常粗略的,没有考虑可能存在的空间位阻的影响。

adf/hbd-hba.txt · 最后更改: 2023/08/22 22:27 由 liu.jun

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