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adf:gcmc2020

这是本文档旧的修订版!


ReaxFF-GCMC:巨正则系综蒙特卡洛模拟

建模

View - Periodic - Show Unit Cell:

点击底部四边形按钮,切出表面:

Edit - Crystal - Generate Super Cell,生成超胞3*3。

参数设置

注意Task选择GCMC,周期性这里是Slab(二维周期性,上下表面外部为半无限大真空),用户需要自行决定是否改为Bulk:

点击Molecules前面的+,可以增加一种粒子源,这里只设置一种。Molecule下拉菜单选择New Molecule,左侧窗口增加了一个,用户可以将粒子创建在该窗口中。窗口底部的Mol-1、Mol-2可以切换:

用户还需要设定:

  • 系综(Mμ-VT化学势、体积、温度恒定,Mμ-PT化学势压强温度恒定)
  • MC的步数,这里设定为40000
  • 温度,这里设置1500K。
  • ‘Chemical Potential’,这里设置为-75kcal/mol。

注意:化学势的计算

这个值可以用统计力学从第一原理推导出来,或者从文献资料中的热化学表中查询。单个氧原子的化学势等于同温度压强下$O_2$化学势的1/2。化学势计算公式:

  • μ$_{O2}^{ref}$(T,P$_{ref}$)是$O_2$在温度T、压强P$_{ref}$下的化学势
  • k为波尔兹曼常数,T为温度
  • P是$O_2$的分压。如果只有$O_2$一种气体,那么kT*ln(P/P$_ref$)=kT*ln1=0
  • E$_{O2}^{diss}$是分子的解离能,也就是分子解离为原子所需的能量(正值)

结果查看

在movie中可以看到Si的氧化结果:

初始帧即为GCMC最后一步的结果。第2帧开始显示逐渐氧化的过程,最后一帧与第一帧相同。

注意

ReaxFF模块的GCMC粒子源目前只能是原子,ReaxAMS的粒子源则没有这样的限制。设置方法与ReaxFF类似。

adf/gcmc2020.1606389804.txt.gz · 最后更改: 2020/11/26 19:23 由 liu.jun

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