本文虽然以ReaxFF分子动力学模拟结果为例，但实际上BAND、DFTB、MOPAC分子动力学结果，均可如此分析。

常规的分子动力学计算完毕之后，在Movie中即可分析指定分子、原子的自相关函数与扩散系数：

SCM - Movie - MD Properties - Autocorrelation Functions:

• Step，设置分析的时间段，从多少帧到多少帧
• Property，选择扩散系数（同时也会生成自相关函数）
• Atoms，在左侧窗口选择要分析的分子或原子，点击右侧窗口的＋按钮

点击Generate ACF：

生成了ACF与扩散系数，这里扩散系数为4.085 × 10^-8 m²/s

注意，扩散系数是一个严重受统计样本影响的量，所以建议多个样本求均值。