这是本文档旧的修订版!
ADF2016.102版增加了基于DFT的分子动力学模拟功能。ADF模块、BAND模块、DFTB模块等包含这个功能(目前正在不断完善中,有兴趣的用户可以尝试使用):
ADF模块的DFT分子动力学模拟和BAND很类似,可以参考本案例。
参数设置(基组、泛函等,参考【入门基础教程】单点计算与BAND的基本参数设置,DFT分子动力学模拟,比一般的结构优化计算设置的精度要低一个等级):
k空间设置为最低精度-basic。用户也可以点击后面的…符号,手工指定k点个数,例如2 2 2
Model > MD设置分子动力学参数,Number of steps是模拟的步数,步长一般0.25fs是比较合适的,所以这个例子里面模拟了2.5ps。Sample Frequency是指每100步保存一次原子运动轨迹。
如果要实现温度变化,参考controlt
只需要设置系综实现的方案Thermostat、Temperature(与前面的温度一致)、Damping constant。其中Damping constant表示震荡时间(在达到指定温度前,温度随机震荡),一般默认设置100fs,也可以降低为10fs,对结果影响不大。