adf:creatsubstitutes
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| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:creatsubstitutes [2020/11/27 19:41] – liu.jun | adf:creatsubstitutes [2020/11/27 19:43] (当前版本) – [取代基效应研究（批量建模）] liu.jun | ||
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| ======取代基效应研究（批量建模）====== | ======取代基效应研究（批量建模）====== | ||
| + | 本文基于AMS2020.101以上版本。 | ||
| =====准备取代基===== | =====准备取代基===== | ||
| 用户可以创建自己常用的取代基到图形界面中，便于平时使用，创建方法参考：[[adf: | 用户可以创建自己常用的取代基到图形界面中，便于平时使用，创建方法参考：[[adf: | ||
| 行 37: | 行 38: | ||
| 下面几行是循环的内容，也就是< | 下面几行是循环的内容，也就是< | ||
| - | <code bash>" | + | <code bash>" |
| * -t UFF-GO表示使用UFF力场优化结构，字母t是task的意思，GO是geometry optimization的意思； | * -t UFF-GO表示使用UFF力场优化结构，字母t是task的意思，GO是geometry optimization的意思； | ||
| * -m Benzene.xyz字母m是molecule的意思，后面接的是我们一开始创建好的苯分子的xyz文件； | * -m Benzene.xyz字母m是molecule的意思，后面接的是我们一开始创建好的苯分子的xyz文件； | ||
| 行 45: | 行 46: | ||
| <code bash>sh " | <code bash>sh " | ||
| - | <code bash>" | + | <code bash>" |
| <code bash>mv uff.rkf " | <code bash>mv uff.rkf " | ||
| 最后以done结尾和开头的for呼应，for和done之间的几行，表示循环执行的内容，遍历所有自由基后，循环结束。 | 最后以done结尾和开头的for呼应，for和done之间的几行，表示循环执行的内容，遍历所有自由基后，循环结束。 | ||
adf/creatsubstitutes.1606477296.txt.gz · 最后更改: 2020/11/27 19:41 由 liu.jun