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adf:creatslabfromunitcell [2020/02/08 13:37] – liu.jun | adf:creatslabfromunitcell [2020/05/07 15:02] (当前版本) – liu.jun | ||
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======从已知单体平面结构,创建二维周期性结构====== | ======从已知单体平面结构,创建二维周期性结构====== | ||
- | 例如单体结构如下(1,2,3,4原子为悬挂键将与近邻单体连接),注意调整分子所在平面为xy平面(选中任意两个原子,Edit - Align - With X Axis,则这两个原子的指向X轴,类似设定y轴,这样整个分子就在xy平面了): | + | 例如单体结构如下(1,2,3,4原子为悬挂键将与近邻单体连接),并根据三个点确定一个面的原则,选中平面上三个原子,Edit - Align - With XY-Plane,使得分子在XY平面上: |
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- | 测量二维晶格的晶格常数a与b(a、b顺序是任意的,其中一个为a,另一个即b),及其夹角: | + | 选中两个相邻单体中等价的原子,测量二维晶格的晶格常数a |
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- | a=1440.1 pm = 14.4埃 | + | a=1440.1 pm = 14.4 Å |
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- | b=1449.4 pm = 14.5埃 | + | b=1449.4 pm = 14.5 Å |
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- | ab之间夹角59.6°,当然120.1°也对。 | + | ab之间夹角59.6°或180°- 59.6°,其中一个值是对的。 |
新开一个Input窗口,切换到BAND模块,Edit - Crystal - From Space Group,输入如下数据: | 新开一个Input窗口,切换到BAND模块,Edit - Crystal - From Space Group,输入如下数据: | ||
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- | 确实是正确的,没有出现原子重叠的情况。之后使用DFTB、MOPAC进行结构优化即可,当然晶格常数也需要优化: | + | 确实是正确的,没有出现原子重叠的情况。如果单元与单元之间连接方式不正确,可以适当转动最小重复单元即可。之后使用DFTB、MOPAC进行结构优化即可,当然晶格常数也需要优化: |
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