adf:creatslabfromunitcell

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--- adf:creatslabfromunitcell [2020/02/08 02:23] – 创建 liu.jun
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 ======从已知单体平面结构，创建二维周期性结构======
-例如单体结构如下：
+例如单体结构如下（1，2，3，4原子为悬挂键将与近邻单体连接），并根据三个点确定一个面的原则，选中平面上三个原子，Edit - Align - With XY-Plane，使得分子在XY平面上：
-{{: adf:cell-slab01.png?300 }}
+{{ :adf:cell-slab01.png?300 }}
 首先，通过复制、粘贴、拖动、Bonds-Add bond，在该单体周围重复这个单体，直到能看出周期性：
-{{: adf:cell-slab02.png?350 }}
+{{ :adf:cell-slab02.png?350 }}
-测量二维晶格的晶格常数a与b（a、b顺序是任意的，其中一个为a，另一个即b）：
+选中两个相邻单体中等价的原子，测量二维晶格的晶格常数a
+{{ :adf:cell-slab03.png?450 }}
-{{: adf:cell-slab03.png?450 }}
+a=1440.1 pm = 14.4 Å
-a=1440.1 pm = 14.4埃
+{{ :adf:cell-slab04.png?450 }}
-{{: adf:cell-slab04.png?450 }}
+b=1449.4 pm = 14.5 Å
-b=1449.4 pm = 14.5埃
+{{ :adf:cell-slab05.png?450 }}
-{{: adf:cell-slab05.png?450 }}
+ab之间夹角59.6°或180°- 59.6°，其中一个值是对的。
-ab之间夹角59.6°
 新开一个Input窗口，切换到BAND模块，Edit - Crystal - From Space Group，输入如下数据：
-{{: adf:cell-slab06.png?350 }}
+{{ :adf:cell-slab06.png?350 }}
 将Input右侧Main - Periodicity改为Slab，将单体复制粘贴进来，建模即完成，得到：
-{{: adf:cell-slab07.png?660 }}
+{{ :adf:cell-slab07.png?660 }}
-点击右下角的按钮，切换为显示3*3个周期：
+点击右下角的按钮，切换为显示3*3个周期（注意，这只是显示模式的区别，实际上模型、原子数，是一样的）：
-{{: adf:cell-slab08.png?660 }}
+{{ :adf:cell-slab08.png?660 }}
-确实是正确的，没有出现原子重叠的情况。之后使用DFTB、MOPAC进行结构优化即可，当然晶格常数也需要优化：
+确实是正确的，没有出现原子重叠的情况。如果单元与单元之间连接方式不正确，可以适当转动最小重复单元即可。之后使用DFTB、MOPAC进行结构优化即可，当然晶格常数也需要优化：
-{{: adf:cell-slab09.png?360 }}
+{{ :adf:cell-slab09.png?360 }}

adf/creatslabfromunitcell.1581099827.txt.gz · 最后更改: 2020/02/08 02:23 由 liu.jun

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