adf:cddofgs

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-====== 如何计算片段差分密度（即：分子与片段的电子密度之差、碎片形成整体导致的电荷转移方向） ======
-**本例以BH<sub>3</sub>-NH<sub>3</sub>为例：**
-第一步，[[adf:geoopt|优化基态的分子结构（详情请点击）]];
-第二步，导入优化好的分子结构，划分片段，进行计算，如下图所示：
-按住Shift键，鼠标画框，选中NH<sub>3</sub>，然后选择右侧窗口的Model > Region，点击加号，如下图
-{{ :adf:cdd_ground01.png?650 |}}
-则成功将NH<sub>3</sub>设定为Region_1(此处更名为NH3)；可以用同样的方式，将BH3设定为Region_2(此处更名为BH3)，如下图所示<color blue>（切记避免个别原子既被归入一个区，又被归入另一个区）</color>
-{{ :adf:cdd_ground02.png?650 |}}
-启动片段功能：
-{{ :adf:cdd_ground03.png?650 |}}
-主面板参数设置如下图所示（基组、泛函选择参考[[adf:parameters]]）
-{{ :adf:cdd_ground04.png?650 |}}
-保存任务，并运行。
-第三步，结果查看：
-在ADFinput窗口点击SCM LOGO > View，弹出View窗口。点击Field > Calculated，窗口底部Select Field区域，分别如下图所示，选择Density - Density SCF（当前二聚体电子密度），以及Density - Density Sum Frag（孤立碎片电子密度简单叠加）
-{{ :adf:cdd_ground05.png?650 |}}
-此时注意，Density SCF - Density Sum Frag这个函数的名称为C-1（窗口左下角）。因此我们把C-1这个函数显示出来：Add - Isosurface:with phase，之后底部Select Field窗口选择other - "C-1"，同时修改等值面的值，使得图像更方便查看，因此改为0.01。如下图所示：
-{{ :adf:cdd_ground06.png?650 |}}
-为了更方便观察电子密度与原子核的位置，我们把C-1函数用半透明的方式显示：点击窗口底部的Isosurface: With Phase按钮 - Show details，然后将下图所示的位置，默认100改为40（值越小透明度越低，100为不透明，0为完全透明）。
-{{ :adf:cdd_ground07.png?650 |}}
-<color blue>图中红色与蓝色，表示电子的流向。其中蓝色区域表示得到了电子，红色区域表示失去了电子。</color>
-AMS软件提供**免费试用**（一般为一个月），试用申请方式参见：[[adf:trial|]]**

adf/cddofgs.1575530921.txt.gz · 最后更改: 2019/12/05 15:28 由 liu.jun

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