差别

这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。

--- adf:buldpolymers [2019/05/30 12:33] – [2，设置连接方式] liu.jun
+++ adf:buldpolymers [2023/10/01 21:02] (当前版本) – [聚合物固体的建模] liu.jun
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 ======聚合物建模======
-版本要求不低于AMS2019.102。本文以高抗冲聚苯乙烯（HIPS）为例演示AMS的聚合物建模功能。
+版本要求不低于AMS2020.101。本文以高抗冲聚苯乙烯（HIPS）为例演示AMS的聚合物建模功能。
 HIPS是一种低成本、易生产、易加工、低强度、抗冲击的热塑性塑料，是一种接枝聚合物，主链为聚苯乙烯，各向分支为聚丁二烯链。
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 =====一、单一组分聚合物建模======
 ====1，导入单体、设置“连接点”====
-这里以纯的聚苯乙烯为例进行演示。ADFinput → Edit → Polymer... → Add monomer:输入styrene，窗口左边出现苯乙烯单体：
+这里以纯的聚苯乙烯为例进行演示。AMSinput → Edit → Polymer... → Add monomer:输入styrene，窗口左边出现苯乙烯单体：
 {{ :adf:polimer01.png?600 }}
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 用户也可以选择其他H原子作为连接点：选中H原子，点击窗口右边的“Set link point”旁边的“Replace”按钮，该H原子就成为了新的连接点。下面的步骤中，用户可以根据需要指定连接方式。
-用户也可以自建单体：在ADFinput中，创建分子或通过File → Import Coordinates导入分子均可。然后自定义“连接点”即可进行后面的操作。
+用户也可以自建单体：在AMSinput中，创建分子或通过File → Import Coordinates导入分子均可。然后自定义“连接点”即可进行后面的操作。
 ====2，设置连接方式====
 设置聚合物的单体数量：Mononmer repeats输入单体数量，例如200，则生成的聚合物包含总共200个单体。
-点击Link旁边的➕，选择连接方式，例如：
+点击“Links”旁边的➕，选择连接方式，例如：
 {{ :adf:polimer02.png?600 }}
-权重是描述这种连接方式，在聚合物中的占比。用户只要输入相对比例即可，程序会自动计算百分比。例如这里只有一种连接方式，所以默认weight为1。如果有多种连接方式，各种占比相同，则可以都用默认weight：1。可以灵活调整该数值为正数即可。
+权重是描述这种连接方式，在聚合物中的占比。用户只要输入相对比例即可，程序会自动计算百分比。例如这里只有一种连接方式，所以默认weight为1。如果有多种连接方式，如果各种占比相同，则可以都用默认weight：1。用户可以灵活调整该数值为正数即可。
 随机性：勾选Random seed选项，程序会自动随机地生成聚合物结构。当然对于纯的聚苯乙烯而言，确定了两个连接点，实际上就没有随机性了。但是有多种组分的时候，随机性就会发生作用了。
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 {{ :adf:polimer03.png?600 }}
-====3，使用UFF优化分子结构====
+====3，使用力场优化分子结构====
-点击“Close”按钮，关闭建模窗口，切换到UFF模块优化分子结构：
+点击“Close”按钮，关闭建模窗口，切换到Force Field模块优化分子结构：
 {{ :adf:polimer04.png?600 }}
-File → Save as保存并运行任务，任务结束，窗口弹出是否更新分子结构的提示，点击yes，将得到合理的聚合物分子结构。提交任务更详细的设置，参考：[[adf:maintance]]
+File → Save as保存并运行任务。任务结束后，窗口弹出是否更新分子结构的提示，点击yes，将得到合理的聚合物分子结构。提交任务更详细的设置，参考：[[adf:maintance]]
 =====二、HIPS的建模=====
 ====1，导入单体、设置“连接点”====
-打开ADFinut，如上类似的方式，导入styrene、1,4-butadiene，或者用户自建这两个分子，或通过File → Import Coordinate导入两种分子。导入之后，用鼠标右键将两个分子拖开，便于分别设置两个分子。创建、选中、移动分子等基本操作，参考：[[https://www.jianguoyun.com/p/Dfq5zjUQmZ2ZBhjprSc|ADF的基本建模功能（视频）]]
+打开AMSinut，如上类似的方式，导入styrene、1,4-butadiene，或者用户自建这两个分子，或通过File → Import Coordinate导入两种分子。导入之后，用鼠标右键将两个分子拖开，便于分别设置两个分子。创建、选中、移动分子等基本操作，参考：{{ :adf:creatmolecule.rar |AMS的基本建模功能（视频） }}
 ====2，设置连接点、连接方式 ====
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 {{ :adf:polimer06.png?600 }}
+=====三、聚合物固体的建模=====
+如上只是建立了聚合物分子，从聚合物分子生成固体，需要先创建低密度分子混合物，然后逐渐将其压缩。之所以创建低密度分子混合物，是因为采用Packmol随机刚性堆叠时，分子的间距是有要求的，一般分子间最小距离不小于 2.5 Å，因此刚性堆叠并不能生成高密度体系。
+过程参考：[[adf:highdensity]]

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