如果活化能是应用于厄伦尼乌斯公式，用来计算反应速率，那么“能量”一般采用计算结束之后得到的Total Bonding energy（*.logfile尾部的“Bond Energy”，亦即*.out文件中“Total Bonding Energy”或“Energy from Engine”），加上零点能（SCM → Output → Other Properties → Zero-Point Energy ，计算频率默认就可以得到该值）。

如果考虑外部条件，则可以用Gibbs自由能的计算时，得到的焓（Enthalpy H）来相减。

如果用Gibbs自由能相减，这个能量差值，是不能用于厄伦尼乌斯公式的。